通过计算机程序模拟产生简化DNA甲基化测序数据的方法

摘要

本发明公开了一种通过计算机程序模拟产生简化DNA甲基化测序数据的方法，可以用来评估不同简化基因组甲基化(RRBS)测序数据比对软件的效率以及相应数据分析平台的可靠性，以此来确定最优的比对方法及相应的最优参数。本发明通过计算机程序模拟RRBS文库构建和测序过程，根据CpGs甲基化水平的分布，产生与真实RRBS测序数据非常相近的仿真数据。该仿真数据除了模拟单个碱基水平的甲基化水平外，还模拟了真实数据的插入、缺失、单核苷酸变异和结构变异等其他特性以增加真实性。此外，本发明在模拟RRBS测序过程中，通过引入经验误差模型来模拟测序过程中出现的误差，进一步增加了仿真数据的真实性。