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基于肿瘤新抗原特征值的新抗原活性预测和排序方法

摘要

本发明公开了一种基于肿瘤新抗原特征值的新抗原免疫活性打分和排序方法,包括以下步骤:肿瘤‑正常样本的WGS/WES、RNA‑seq测序数据的输入,肿瘤体细胞突变的预测及注释、相关特征值计算;基于肿瘤体细胞突变的MHC‑I结合新抗原预测、相关特征值计算;新抗原相关特征值的提取;新抗原活性打分函数的设定;基于新抗原活性打分函数的新抗原排序。本发明首先分析计算出肿瘤体细胞的突变并完成突变注释,计算出部分特征值,然后预测MHC‑I结合新抗原,计算出部分特征值;提取肿瘤新抗原的所有相关特征值,进而设定新抗原活性打分函数,最后通过新抗原活性打分函数对新抗原进行排序。本方法与传统的筛选方法相比更为高效精准,对于肿瘤免疫疗法具有重要的应用价值。

著录项

  • 公开/公告号CN107704727B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-01-31

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 杭州风起智能科技有限公司;

    申请/专利号CN201711071334.8

  • 申请日2017-11-03

  • 分类号G16B20/00(20190101);G01N33/53(20060101);

  • 代理机构33280 杭州永曙知识产权代理事务所(特殊普通合伙);

  • 代理人曹康华

  • 地址 310019 浙江省杭州市江干区九环路9号3幢2楼301-3室

  • 入库时间 2022-08-23 10:49:31

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-01-31

    授权

    授权

  • 2018-03-16

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20171103

    实质审查的生效

  • 2018-03-16

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/18 申请日:20171103

    实质审查的生效

  • 2018-02-16

    公开

    公开

  • 2018-02-16

    公开

    公开

  • 2018-02-16

    公开

    公开

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