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一种环境微生物基因组草图的构建方法

摘要

本发明公开了一种基于微量细胞全基因组测序的环境微生物基因组草图的构建方法,通过对多个环境微生物微小宏基因组样本分别进行核酸分离,扩增,构建高通测序文库,然后对测序数据进行过滤、从头组装、开放阅读框预测,使用基于隐马尔科夫模型的算法将序列分类,获得微生物基因组草图。该方法根据环境样本微生物群落的复杂度调整平行试验的次数,以获得最优的分析结果,可应用于土壤、空气、水体、人体等各种环境的微生物群落研究。

著录项

  • 公开/公告号CN105420375B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-01-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京大学;

    申请/专利号CN201510983092.4

  • 发明设计人 万成;文平;陆祖宏;康玉麟;

    申请日2015-12-24

  • 分类号C12Q1/6806(20180101);G16B40/00(20190101);

  • 代理机构11360 北京万象新悦知识产权代理有限公司;

  • 代理人李稚婷

  • 地址 100871 北京市海淀区颐和园路5号

  • 入库时间 2022-08-23 10:49:02

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-01-21

    授权

    授权

  • 2016-04-20

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20151224

    实质审查的生效

  • 2016-04-20

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q 1/68 申请日:20151224

    实质审查的生效

  • 2016-03-23

    公开

    公开

  • 2016-03-23

    公开

    公开

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