一种识别猕猴桃杂交亲本对子代基因组贡献比例的方法

摘要

本发明公开一种识别猕猴桃杂交亲本对子代基因组贡献比例的方法。它包括：对杂交双亲和子代及远缘外类群进行基因组低深度测序；测序数据的参考基因组比对和单碱基变异信息获取；基于单碱基变异的基因组窗口划分和对数可能性估计；分窗口最大可能基因树构建和置信区间估计；杂交双亲在基因树水平与子代遗传关系统计及基因组贡献比例预测。本发明利用整基因组变异信息解析杂交亲本与杂交子代的进化遗传关系，使得对杂交子代特征性状的预测具有较高的准确性；同时使用该方法可以在杂交子代形成的童期对其可能存在的表型特征变异的幅度和方向进行预测，可以极大的促进杂交株系的早期筛选，节省人力物力成本，并大大提高资源发掘利用效率。