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一种物种间基因家族亲缘关系计算方法

摘要

本发明公开了一种物种间基因家族亲缘关系计算方法,包括确定一个基因家族为指定基因家族,计算两个考察物种谁与参考物的指定基因家族亲缘关系更近,计算方法为将参考物种指定基因家族的基因分别与两个考察物种指定基因家族的基因进行两两序列比对,分别获取多个阈值条件下的考察物种的参考物种非冗余基因数量,确定相同阈值条件下考察物种间的参考物种非冗余基因数量的差值的绝对值最大且参考物种非冗余基因数量较多所对应的考察物种为与参考物种指定基因家族亲缘关系更近,可认为该考察物种与参考物种具有更相似的相应形态发育特征,而应用于优势物种或目的物种的筛选,还可反映不同物种间基因家族的进化关系。

著录项

  • 公开/公告号CN106980776B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-05-24

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 重庆邮电大学;

    申请/专利号CN201710229007.4

  • 申请日2017-04-10

  • 分类号

  • 代理机构重庆乐泰知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人刘佳

  • 地址 400065 重庆市南岸区南山街道崇文路2号

  • 入库时间 2022-08-23 10:33:36

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-05-24

    授权

    授权

  • 2017-08-18

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/22 申请日:20170410

    实质审查的生效

  • 2017-08-18

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/22 申请日:20170410

    实质审查的生效

  • 2017-07-25

    公开

    公开

  • 2017-07-25

    公开

    公开

  • 2017-07-25

    公开

    公开

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