单核苷酸距离多态性比较核酸序列进行物种分类的方法

摘要

本发明提出了一种单核苷酸距离多态性比较核酸序列进行物种分类的方法，包括如下步骤：S10：对DNA序列或者RNA序列上的每个核苷酸进行编号；S20：计算DNA序列或者RNA序列上相邻同种核苷酸的距离；S30：统计每种核苷酸的不同距离在每条DNA序列或者RNA序列中出现的次数；S40：根据S30的统计数据，构建距离矩阵，根据距离矩阵计算产生系统发育树，进行物种分类。本方法将序列上核苷酸的差异转变为核苷酸间距离的差异，既兼顾了空位，又无需插入间隔，方法简单，大大简化了计算量。