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一种RNA编辑事件识别方法

摘要

本发明涉及分子遗传学和信息技术领域,使用计算机信息技术解决分子遗传学中的RNA编辑事件的识别问题。本发明提出了一种系统整合的RNA编辑事件识别机制,以及其高效率实现的解决方案。本发明提出的机制包括规则型滤除算法和统计型滤除算法两大模块,其中规则型模块考虑测序的实际特点和可能变异位点在基因中的分布,并对可能变异位点设定规则进行约束;统计型模块则在规则型模块处理后,对符合规则约束的位点进行统计学计算,并根据结果判断是否落入拒绝域,确定可能变异位点是否被滤除。为了实现上述机制,本发明还提出了一种高效率的识别机制实现方案。即使用高级编程语言、数据库和统计学工具相结合的方式实现相应算法模块。

著录项

  • 公开/公告号CN104598775B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-10-16

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京邮电大学;

    申请/专利号CN201410854261.X

  • 发明设计人 孙咏梅;吴迪;黎星;纪越峰;

    申请日2014-12-31

  • 分类号G06F19/24(20110101);G06F19/28(20110101);

  • 代理机构

  • 代理人

  • 地址 100876 北京市海淀区西土城路10号

  • 入库时间 2022-08-23 10:19:09

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-10-16

    授权

    授权

  • 2015-05-27

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/24 申请日:20141231

    实质审查的生效

  • 2015-05-27

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/24 申请日:20141231

    实质审查的生效

  • 2015-05-06

    公开

    公开

  • 2015-05-06

    公开

    公开

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