一种基于序列使用代价敏感集成和聚类预测表位的方法

摘要

本发明属于计算生物信息技术，具体涉及一种基于序列使用代价敏感集成和聚类预测表位的方法。主要步骤包括：(1)构建抗原蛋白残基的描述性特征，这些特征包括进化保守性特征、二级结构特征、无序区域特征、二肽构成特征、理化属性；(2)使用Fisher‑Markov和增量迭代特征选择方法选择最优特征子集；(3)使用代价敏感性集成学习处理不平衡数据集；(4)使用空间聚类算法从抗原决定残基中预测潜在的表位残基。本发明适用于已知和未知结构信息的抗原蛋白表位预测，也适合大规模推广应用。