获取细菌16S rRNA基因的V3区核苷酸序列的方法及其专用引物

摘要

本发明公开了一种获取细菌16S rRNA基因的V3区核苷酸序列的方法及其专用引物。本发明的专用引物是由序列表的序列17和序列19所示的核苷酸组成的特异引物对。本发明提供的方法，包括如下步骤：(1)以细菌的基因组DNA为模板，用通用引物进行PCR扩增；通用引物是由序列表的序列17和序列18所示的核苷酸组成的引物对；(2)以步骤(1)的PCR产物为模板，用所述特异引物对进行PCR扩增；(3)将步骤(2)的PCR产物采用测序引物进行测序；测序引物的核苷酸序列如序列表的序列20所示。本发明提供的用于细菌多样性分析的针对16S rRNA基因V3区的引物对可以直接进行测序，无需借助载体，有助于降低了实验成本，缩短实验的周期，提高实验的准确性。本发明的特异引物对和方法特别适用于针对16S rRNA基因V3区用PCR-DGGE技术分析环境样品细菌多样性试验。