天目山毛竹入侵阔叶林后土壤细菌群落16S rDNA V3区片段PCR的DGGE分析

摘要

天目山国家级自然保护区是公认的基因库.毛竹入侵天然林并替代原天然林,导致地上植物多样性下降.为了解毛竹入侵天然林后地下土壤微生物多样性的变化,分别采集了毛竹纯林、竹阔混交林和原始天然阔叶林下的土壤样品,应用建立于16S rDNA V3区片段的变性梯度凝胶电泳(DGGE)和克隆测序比对来研究土壤细菌结构的变化.结果表明,3块林地土壤16S rDNA V3区片段高达30条以上,不同林分下土壤16S rDNA V3区片段的DGGE带谱差异不大,但各有特征条带.毛竹林与阔叶林土壤的细菌结构相似度高于其与竹阔混交林的相似度.通过DGGE条带的克隆测序比对发现,调查区土壤细菌主要属于变形菌门(Proteobacterium)、厚壁菌门(Firmicutes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线细菌属(Actinobacterium)和一些未命名的菌种,并且多数属无法纯培养的物种.本试验结论为:天目山自然保护区内土壤细菌多样性丰富,不同林分下的土壤细菌有各自的特征种,但非优势种;毛竹入侵未导致土壤细菌结构以及多样性发生显著变化.