基于图卷积网络的微生物与疾病关联关系预测方法与系统

摘要

本发明提供基于图卷积网络的微生物与疾病关联关系预测方法，包括以下步骤：S1：根据微生物与疾病关联网络、微生物与微生物相似性网络以及疾病与疾病相似性网络构建异构网络S2：基于步骤S1构建的异构网络，采用图卷积神经网络分别提取微生物和疾病各层的嵌入特征；S3：采用图卷积神经网络导出的多层注意机制将每一层得到的嵌入特征融合在一起；S4：采用双线性解码器推断得到微生物‑疾病关联关系数据。本发明充分利用异构网络中邻居节点信息和图注意力网络自动提取特征的特点，从而提高微生物与疾病关联关系的预测效果。可为研究人员提供一定的参考信息，大大减少了实验的工作量。