一种MTX耐药肿瘤细胞的高置信断裂点筛选方法

摘要

本发明公开了一种MTX耐药肿瘤细胞的高置信断裂点筛选方法，涉及生物技术领域，利用MTX作为主要治疗药物且易产生耐药性的恶性肿瘤的生物治疗提供新的研究方案，为有效对抗MTX耐药提供了科学的依据，针对MTX耐药且DHFR基因高度扩增的恶性肿瘤细胞，联合应用DELLY、LUMPY和CREST共同调取全基因组测序结构变异数据，并设定具体阈值及标准流程，提高断裂点的验证率，降低断裂点筛选的假阳性率和假阴性率，从而获得高度置信的断裂点合集，进而为研究肿瘤耐药细胞中扩增子的进化及形成机制，去除肿瘤细胞中DMs的形成或逆转肿瘤耐药提供依据。