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一种Hi-C数据分辨率增强方法及装置

摘要

本发明公开了一种Hi‑C数据分辨率增强方法及装置,所述方法包括:获取原始高分辨率Hi‑C数据和原始高分辨率Hi‑C数据所在细胞系的表观基因组数据;对原始高分辨率Hi‑C数据和表观基因组数据进行预处理,得到原始高分辨率Hi‑C数据对应的Hi‑C数据矩阵和表观基因组数据的相关性矩阵;通过Hi‑C数据矩阵和相关性矩阵对预设的神经网络进行训练,得到分辨率增强模型;基于分辨率增强模型,根据分辨率待增强的Hi‑C数据和对应的表观基因组数据,得到相应的增强后的Hi‑C数据。本发明可以适用于具备多种低分辨率Hi‑C数据和表观基因组数据情况下,实现将低分辨率Hi‑C数据增强至1kb高分辨率。

著录项

  • 公开/公告号CN113628112A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-11-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利号CN202110914432.3

  • 申请日2021-08-10

  • 分类号G06T3/40(20060101);G06N3/08(20060101);

  • 代理机构11237 北京市广友专利事务所有限责任公司;

  • 代理人张仲波;付忠林

  • 地址 100083 北京市海淀区学院路30号

  • 入库时间 2023-06-19 13:12:12

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