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基于宏基因组的抗性基因分析方法、装置、介质及终端

摘要

本发明提供基于宏基因组的抗性基因分析方法、装置、介质及终端。所述方法包括:获取多个宏基因组样本的测序原始数据,并对其进行序列质控以获得各宏基因组样本的优化数据;将所述优化数据分别与物种、抗性基因、可移动元件和个性化功能参考数据库进行序列对比,以获得其对应的注释信息;基于所述注释信息统计各样本的丰度信息、占比信息;对所述丰度信息、占比信息和注释信息进行数据挖掘分析,获取抗性基因与物种、可移动元件及个性化功能之间的相关性信息。本发明有利于快速、全面地了解环境中的物种组成、功能组成、抗生素抗性基因在环境中的分布和可移动性等,并且挖掘了抗生素抗性基因与物种、可移动元件及个性化功能之间的相关性。

著录项

  • 公开/公告号CN113611357A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-11-05

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海美吉生物医药科技有限公司;

    申请/专利号CN202011289003.3

  • 发明设计人 丁赟;韩继臣;赵建华;罗春;

    申请日2020-11-17

  • 分类号G16B20/00(20190101);G16B30/10(20190101);G06F16/26(20190101);G16B50/30(20190101);

  • 代理机构31219 上海光华专利事务所(普通合伙);

  • 代理人倪静

  • 地址 201321 上海市浦东新区中国(上海)自由贸易试验区高科中路2810弄8号1204室单元D

  • 入库时间 2023-06-19 13:09:01

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