确定长链非编码核糖核酸相互作用蛋白的新方法

摘要

本发明提供了一种确定长链非编码核糖核酸相互作用蛋白的新方法。本发明提供了由BASU和dCasRx形成的融合蛋白、用于表达所述融合蛋白的哺乳动物表达载体。本发明确定lncRNA相互作用蛋白的方法包括：通过将表达所述融合蛋白的哺乳动物表达载体和特异的靶向目标lncRNA的gRNA共转染到靶细胞中，使BASU对附近的效应蛋白进行特异的生物素化标记；使用链霉素亲和偶联的磁珠分离生物素化的蛋白质，然后进行洗脱，胰蛋白酶消化和质谱的无标记定量分析。本发明可以高度可信地确定与lncRNA相互作用的蛋白质。