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一种基于多角度编码和特征选择的DNA结合蛋白识别方法

摘要

本发明公开了一种基于多角度编码和特征选择的DNA结合蛋白识别方法,包括,在训练阶段,iDBP‑DEP利用四种表示方法对蛋白质序列进行编码,得到3240维的特征向量作为初始特征;根据特征选择算法选择最优的特征子集;所述iDBP‑DEP将所述子集输入SVM分类器进行训练,得到预测模型;测试集中的每个蛋白质通过相同的步骤进行编码,得到对应的最佳特征子集,并输入所述预测模型中进行预测,最终获得相应的预测结果。本发明方法提供的iDBP‑DEP在各项评估指标上均展现了优越的性能,具有较良好的有效性和稳定性。

著录项

  • 公开/公告号CN113555064A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-10-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 江南大学;

    申请/专利号CN202110815562.1

  • 发明设计人 宋晓宁;周李玲;冯振华;

    申请日2021-07-19

  • 分类号G16B40/20(20190101);G16B50/30(20190101);G16B30/10(20190101);G16B25/00(20190101);G06K9/62(20060101);

  • 代理机构32272 南京禹为知识产权代理事务所(特殊普通合伙);

  • 代理人王晓东

  • 地址 214122 江苏省无锡市滨湖区蠡湖大道1800号

  • 入库时间 2023-06-19 13:00:48

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