一种捕获cfDNA5hmC片段的检测方法

摘要

本发明公开了一种捕获cfDNA5hmC片段的检测方法，包括以下步骤：步骤一：预先准备需要使用的试剂，置于冰上，建立体系，温度时间为37℃、2h；步骤二：加入2.5μlDBCO‑PEG4‑biotin,37℃，孵育2h；步骤三：再使用MicroBio‑spin30column(Bio‑Rad)纯化；步骤四：取5μlCI磁珠，吹打均匀后置于磁力架上，待澄清后吸走上清液，加50μl的2*buffer1在旋转架上孵育3min后。该种捕获cfDNA5hmC片段的检测方法，利用链霉亲和素涂层磁珠扩增生物素化的DNA片段。该磁珠可以进行“下拉”分析，将具有5hmC的DNA分子与没有生物标记的DNA分子分离，通过对目标片段进行测序和生物信息学分析，最终获得表观遗传标记，很大程度上提高了5hmC捕捉的效率。