一种基于条形码序列的读长比对方法和装置

摘要

一种基于条形码序列的读长比对方法和装置，该方法包括：将含有条形码序列的测序读长比对到参考基因组得到每个读长的初始比对位置；根据重复数据库对每个读长的初始比对位置进行判定，初始比对位置在重复数据库内的读长判定为比对到重复区域；对于比对到重复区域的读长，找到与该读长具有相同的条形码序列但比对到非重复区域位置的读长，然后从具有相同的条形码序列并比对到重复区域的读长中挑选与非重复区域位置之间的距离不超过建库最大插入片段长度的读长，以其比对位置作为具有该条形码序列的读长的真正比对位置。本发明对于预判定为比对不准确的读长，根据具有相同条形码序列的读长的正确比对位置来调整重复区域的位置，以改进比对的准确性。