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一种基于滤波降噪的基因组结构变异检测方法

摘要

本发明提出了在一种基于滤波降噪的基因组拷贝数变异检测方法,该方法考虑了染色体序列本身的特性以及序列中碱基GC含量对读深的影响,在更好的对数据进行预处理的基础上,将读深数据与高斯核函数进行卷积运算得到尺度空间图像函数,并对尺度空间图像进行边缘检测及基准检测,确定候选拷贝数区域,及检测拷贝数变异类型和位置,提高了拷贝数变异检测的精度。

著录项

  • 公开/公告号CN113436678A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-09-24

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 哈尔滨因极科技有限公司;

    申请/专利号CN202110764922.X

  • 发明设计人 刘志岩;刘珍;王海宁;姜玥;

    申请日2021-07-07

  • 分类号G16B20/10(20190101);G16B30/00(20190101);

  • 代理机构50219 重庆百润洪知识产权代理有限公司;

  • 代理人杨光

  • 地址 150000 黑龙江省哈尔滨市经开区哈南工业新城星海路20号A栋301

  • 入库时间 2023-06-19 12:42:10

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-06-24

    发明专利申请公布后的撤回 IPC(主分类):G16B20/10 专利申请号:202110764922X 申请公布日:20210924

    发明专利申请公布后的撤回

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