一种HIV亚型分类系统及分类方法

摘要

本发明涉及生物信息领域，尤其涉及一种HIV亚型分类系统及分类方法。本发明构建的HIV亚型分类系统包括数据库池、分型模块和数据管理模块，数据库池囊括了已知的所有基因型和基因亚型的HIV序列。数据库管理模块可以定期自动化完成公共数据库数据的下载工作，自动化完成比对数据库构建、扩容与数据库池整合工作。通过引入数据库池和三个分型模块，大大提高对HIV分型工作的准确度和效率。用户只需要输入HIV测序结果，数据库系统就可以自动完成数据标准化、序列分型工作，用户可以继续根据需要将新获得的标准化序列收录至数据库池。