一种基于PAM聚类算法的基因表达数据分析方法

摘要

一种基于PAM聚类算法的基因表达数据分析方法，涉及数据分析领域。本发明包括：数据获取、数据预处理、基因模块识别、GO富集分析、PPI网络构建、HUB基因识别和HUB基因验证。本发明在充分利用基因表达数据包含信息的基础上，可以通过多次迭代为每个基因寻找最佳隶属模块，故识别出的基因模块更加可靠。本发明可更好地挖掘出基因模块中包含的隐藏信息，从而对所要解决的生物信息学问题进行全面分析。本发明中通过对基因表达数据进行数据预处理，解决了基因表达数据中存在的噪声多、无关基因多、数据稀疏等问题。本发明通过下游的生物信息学分析流程，可完成一系列生物信息学分析，可以对待解决的生物信息学问题进行全面的分析与解释。