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一种基于深度学习的RNA和蛋白质结合位点的识别方法

摘要

本发明公开了一种基于深度学习的RNA和蛋白质结合位点的识别方法,其方法为:识别方法分为两部分:数据处理和模型设计训练,各部分主要步骤如下:第一步、数据处理:步骤1、原始数据去冗余;步骤2、预测二级结构信息;步骤3、对步骤2中获得的二级结构进行编码;步骤4、将所有数据保存在对应的csv文件中作为输入数据;第二步、模型设计及训练:步骤1、编码为数据矩阵作为模型输入;步骤2、两个特征矩阵维度相同;步骤3、将组合特征输入到编码器中;步骤4、最终编码器编码的结果;步骤5、经过sigmoid函数得到最终类别。有益效果:利用Transformer网络学习序列的长依赖性和对特征进行编码,能够有效地预测RNA和蛋白质的结合位点。

著录项

  • 公开/公告号CN113178229A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-07-27

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 吉林大学;

    申请/专利号CN202110597078.6

  • 发明设计人 朱晓冬;李泽晋;刘元宁;

    申请日2021-05-31

  • 分类号G16B20/30(20190101);G06N3/04(20060101);

  • 代理机构22212 长春市恒誉专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人鞠传龙

  • 地址 130012 吉林省长春市前进大街2699号

  • 入库时间 2023-06-19 12:00:51

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-03-08

    授权

    发明专利权授予

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