一种基于转录组测序挖掘黄连小檗碱生物合成相关基因的方法

摘要

本发明公开了一种基于转录组测序挖掘黄连小檗碱生物合成相关基因的方法，包括：观察小檗碱的分布，并测定黄连各组织中的生物碱成分与含量；提取黄连四个组织的总RNA，构建转录组数据集，过滤组装后获得黄连Unigene库并功能注释，分析差异表达基因并筛选与异喹啉生物碱生物合成相关酶基因功能相同的差异表达基因；将筛选后的差异表达基因的FPKM值与生物碱含量进行相关性分析，选取与小檗碱含量相关的基因作为其合成相关基因。本发明成功构建出了四个组织的转录组数据库，并挖掘出13个参与黄连小檗碱生物合成的关键候选基因，为分析黄连中异喹啉生物碱生物合成的分子机制奠定了基础，也为利用基因工程技术提高黄连中小檗碱含量提供了遗传资源和技术支持。