基于转录组测序花烟草响应盐胁迫活性氧清除相关基因的挖掘

摘要

为了鉴定参与花烟草盐胁迫响应的活性氧清除相关基因,用200 mmol/L NaCl处理花烟草幼苗,并在处理后12 h采集其幼苗样本,提取总RNA,采用高通量测序技术,进行转录组测序.基于差异表达基因GO及KEGG分析的基础上,对参与其中的活性氧清除基因进行挖掘,利用qRT-PCR的方法验证转录组测序结果.结果表明,盐处理后,花烟草基因表达量变化在2倍以上的基因有7239个(P<0.01),其中,上调表达基因4037个,下调表达基因3162个,将其功能归类于生物过程、细胞组分及分子功能三大类159个GO条目,并显著富集在12条KEGG代谢通路中.同时,在盐胁迫下,花烟草有45个活性氧清除相关基因的表达发生了显著改变,其中,上调表达基因28个,下调表达基因17个.此结果说明,活性氧的清除是花烟草抵御盐胁迫的重要机制之一.