公开/公告号CN112831592A
专利类型发明专利
公开/公告日2021-05-25
原文格式PDF
申请/专利权人 贵州大学;
申请/专利号CN202110273157.1
申请日2021-03-15
分类号C12Q1/6895(20180101);C12Q1/686(20180101);C12Q1/04(20060101);C12N15/11(20060101);C12R1/645(20060101);
代理机构52106 贵阳中工知识产权代理事务所;
代理人王蕊
地址 550025 贵州省贵阳市花溪区学士路贵州大学南区贵州省生化工程中心
入库时间 2023-06-19 11:05:16
技术领域
本发明属于分子生物学领域,涉及一种采用分子生物学手段鉴定灵芝属真菌的方法,具体为一种用于鉴定灵芝属真菌的引物对及其应用。
背景技术
灵芝是中国名贵中药材,又称仙草、瑞草、万年茸等。灵芝在我国有2000多年的历史,被历代医药家视为滋补强壮、扶正固本的神奇珍品。灵芝富含灵芝多糖,三萜类,甾醇,氨基酸,蛋白质等600余种成分,具有抗癌、抗氧化、抗炎、抗菌、抗高血压、抗动脉粥样硬化、抗衰老、抗辐射等功效,用于治疗癌症,糖尿病,高血压,失眠、厌食症、关节炎、哮喘、支气管炎、胃炎、高胆固醇、红斑狼疮等疾病。《中国药典》将灵芝和紫芝收录其中,认为灵芝是无毒,安全的食品。
灵芝属(
中国灵芝物种多样性丰富,不同的灵芝种类含有的药用成分各异。然而,灵芝种类的鉴定区分非常困难,原因一是灵芝在形态上极为相似,难以根据形态鉴定区分;二是以DNA条形码等分子手段鉴定必须要以高质量的DNA为前提,市售灵芝在保存过程中极易附带其它真菌或者被重寄生真菌污染。无论是栽培灵芝种类的鉴定还是解决市售灵芝种类混杂的问题,提出一个可靠、简便、快速有效的灵芝鉴定方法极为重要。
发明内容
本发明的目的是获得一种鉴定灵芝属真菌的有效方法,利用RPB2蛋白基因的一段DNA序列作为鉴定的条形码,本发明设计了一对扩增RPB2序列的引物,为灵芝属真菌的鉴定提供简便、可靠的方法。
技术方案:一种用于鉴定灵芝属真菌的引物,其特征在于所述引物对及其序列为:
RPB2-F6(RGARACGCAYAAGGAGTTYA)和RPB2-R6(CTRGCACARACWCCYAARAT)。
所述引物在灵芝属真菌鉴定中应用。
所述灵芝真菌鉴定需要主要仪器包括PCR仪,主要试剂包括引物、dNTP、MgSO
所述灵芝鉴定的步骤包括:
⑴ 提取灵芝属真菌的基因组。
⑶ 取PCR扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检
本发明提供了一对扩增RPB2序列的引物,为灵芝属真菌的鉴定提供简便、可靠的方法。
附图说明
图1为实例PCR产物电泳结果;图2为实例鉴定结果。
其中图1M为DNA Maker 5000,1~3为实例PCR扩增灵芝RPB2基因片段电泳检测结果。
其中图2 Blast比对鉴定1~3号为
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市售购买获得的常规产品。
实施例1
一种用于鉴定灵芝属真菌的引物对,所述引物对及其序列为:RPB2-F6(RGARACGCAYAAGGAGTTYA)和RPB2-R6(CTRGCACARACWCCYAARAT)。
所述引物在灵芝属真菌鉴定中应用。
所述灵芝真菌鉴定需要主要仪器包括PCR仪,主要试剂包括引物、dNTP、MgSO4、DNA聚合酶、反应缓冲液,主要软件工具包括Bioedit、MEGA。
所述灵芝鉴定的步骤包括:
(1)提取灵芝真菌的基因组。
(2)以步骤⑴提取的基因组为模板,以RPB2-F6和RPB2-R6为扩增引物,进行如下的反应体系配制和反应程序:
(3)取PCR扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检。
(4)PCR产物直接生工生物工程(上海)股份有限公司测序。
(5)获得序列文件使用Bioedit编辑去头和去尾。
(6) 编辑好的序列使用NCBI的Blast比对功能鉴定灵芝种类。
如图1所示,实例中的PCR产物电泳检测,条带明亮、清晰。
如图2所示,实例中的1~3号样本鉴定为
机译: 分离和纯化真菌Guignardia citricarpa的方法;真菌Guignardia citricarpa的贮藏过程;提取柠檬genus citricarpa木霉属真菌的DNA的方法。获得寡核苷酸引物(Primers)espec u00ecficos,用于检测柑橘Guignardia citricarpa柑橘黑斑病的致病菌株(MPC);寡核苷酸INICIadores(引物),根据用于引起柑橘黑斑病(MPC)的Guignardia citricarpa致病菌株的分子诊断的方法和试剂盒而获得
机译: 用于快速检测和鉴定抗生素抗性基因的常见细菌和真菌病原体以及相关物种,来自临床标本的属特异性和通用探针和引物,用于微生物实验室的诊断
机译: 物种特异性,属特异性和通用性的dna探针和扩增引物,用于快速检测和鉴定临床样品中的病原细菌和真菌以及相关的抗生抗药性,以便在微生物实验室中进行诊断。