液滴单细胞表观基因组谱分析用于患者分层的用途

摘要

本发明的一个方面涉及一种用于抗药性的诊断和/或预后的方法，其中通过使用微流体系统对从受试者获得的细胞中的单细胞染色质状态进行谱分析，所述方法包括以下步骤：a.提供至少第一类型的液滴，其中所述第一类型的液滴包含i.生物要素，ii.裂解缓冲液，和iii.核酸酶；b.在暂时使所述核酸酶失活的条件下收集所述第一类型的液滴；c.孵育所述第一类型的液滴，从而重新激活所述核酸酶；d.提供至少第二类型的液滴，其中所述第二类型的液滴包含核酸序列；e.融合所述第一类型的液滴和所述第二类型的液滴，从而生成第三类型的液滴；f.孵育所述第三类型的液滴，从而将所述核酸序列连接至一个或多个感兴趣的基因组区域；g.对所述一个或多个感兴趣的基因组区域进行测序。本发明进一步的方面涉及一种核酸序列，其包含：a.至少一个索引序列，b.测序接头，和c.至少一个位于3’‑和/或5’‑端处的保护官能团。