基于深度网络快速识别单分子纳米孔测序碱基方法

摘要

本发明公开了一种基于深度网络快速识别单分子纳米孔测序碱基方法，所述的方法包括步骤如下：S1：从测序原始数据中提取电信号序列，对电信号序列进行第一预处理，得到信号矩阵；S2：构建深度网络模型，对深度网络模型进行训练，直至损失函数达到设定阈值或迭代次数达到设定步数；S3：将步骤S1中得到的信号矩阵输入编码器中提取高维特征信息，输出特征信息矩阵；S4：将步骤S3中得到的特征信息矩阵通过全连接网络层映射生成对应于碱基字符表的概率矩阵；S5：采用基于束搜索算法的连接时序分类模块作为解码器对步骤S4得到的概率矩阵进行束搜索，得到若干个碱基序列，选择其中得分最高的碱基序列作为输出结果。