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一种基于深度残差神经网络的蛋白质残基接触预测方法

摘要

一种基于深度残差神经网络的蛋白质残基接触预测方法,首先,通过蛋白质数据库构建数据集;其次,利用HHblits构建所有序列的MSA,根据进化信息提取序列谱特征、香农熵特征、协方差特征,作为神经网络的输入,生成神经网络的标签文件;然后,将数据集输入到神经网络中训练神经网络;最后,将测试序列输入到神经网络中进行预测。本发明提供一种能够有效辅助蛋白质结构预测的蛋白质残基接触预测方法,能够提高蛋白质结构预测的精度。

著录项

  • 公开/公告号CN112085245A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-12-15

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 浙江工业大学;

    申请/专利号CN202010704130.9

  • 申请日2020-07-21

  • 分类号G06Q10/04(20120101);G16B15/00(20190101);G16B30/10(20190101);G06N3/08(20060101);G06K9/62(20060101);

  • 代理机构33241 杭州斯可睿专利事务所有限公司;

  • 代理人王利强

  • 地址 310014 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号

  • 入库时间 2023-06-19 09:10:33

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