被检样品中的细菌数的定量方法

摘要

本发明的课题在于提供能够使用PCR法迅速且精度良好地定量被检样品中的细菌菌数的方法。作为解决上述课题的方法，利用以下的工序进行被检样品中的细菌的鉴定及定量。(1)第一PCR工序，以来源于被检样品的核酸作为模板，使用用于扩增细菌的16S rRNA基因的通用引物对，利用PCR法得到第一扩增产物；(2)第二PCR工序，使用用于扩增利用前述第一PCR工序得到的第一扩增产物所具有的序列的内部序列的引物对，利用巢式PCR法得到第二扩增产物；以及(3)菌数定量工序，使用校准用的数据，从由前述第二PCR工序得到的第二扩增产物的量求出前述被检样品中的细菌数。另外，也可以在上述的工序(1)～(3)的基础上追加以下的工序(4)及(5)。(4)菌种鉴定工序，对前述被检样品中的细菌的菌种进行鉴定。(5)细菌数校正工序，以由前述菌数定量工序求出的细菌数作为暂定细菌数，基于前述对照细菌及由前述菌种鉴定工序鉴定出的菌种的16S rRNA操纵子拷贝数来校正暂定细菌数，从而确定前述被检样品中的细菌数。