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深度测序基因序列数据文件的无损压缩方法

摘要

本发明公开深度测序基因序列数据文件的无损压缩方法,以传输过程中不需要传输的内置标准参考基因组和内置字典文件作为对比。因此如果传输或者存储过程中丢失转换后的基因序列或者本专利压缩后的基因序列数据的话,只要其他人员无法取得内置标准基因和内置字典文件,就无法还原相关的序列,大大加强了安全性。未匹配上的变异,增设临时字典,该字典随着文件压缩和传输。如果第一次未匹配到的特殊变异写入该字典后,后面几百甚至上万次测序数据中出现的该特殊变异就不用另外存储,大大节省了空间。本发明有效的降低了DNA测序序列的数据容量,因此无论存储还是传输过程中容量大大减小了。

著录项

  • 公开/公告号CN111625509A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-09-04

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 福州数据技术研究院有限公司;

    申请/专利号CN202010457824.7

  • 发明设计人 邹斌;刘菊红;何姝颖;

    申请日2020-05-26

  • 分类号G06F16/174(20190101);G16B30/00(20190101);

  • 代理机构35211 福州君诚知识产权代理有限公司;

  • 代理人戴雨君

  • 地址 350000 福建省福州市长乐区数字福建产业园东湖路33号6#楼

  • 入库时间 2023-06-19 08:09:41

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-10-27

    发明专利申请公布后的驳回 IPC(主分类):G06F16/174 专利申请号:2020104578247 申请公布日:20200904

    发明专利申请公布后的驳回

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