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基于单细胞转录组数据的基因表达调控机制的确定方法

摘要

本申请提供一种基于单细胞转录组数据的基因表达调控机制的确定方法,方法包括:根据单细胞转录组数据,确定出中心细胞的特异性高表达基因和邻居细胞的特异性高表达基因;根据中心细胞和邻居细胞的特异性高表达基因,以及配体与受体之间的配对信息,确定出中心细胞与邻居细胞之间的第一子网络;根据中心细胞的特异性高表达基因,以及转录因子与靶基因之间的相互作用信息,确定出中心细胞的第二子网络;根据中心细胞的特异性高表达基因,以及受体与转录因子之间的相互作用信息,确定出中心细胞的第三子网络;根据第一子网络、第二子网络和第三子网络,确定出中心细胞与邻居细胞的细胞间多层信号网络,以揭示邻居细胞对中心细胞的基因表达的调控。

著录项

  • 公开/公告号CN111613268A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-09-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中山大学;

    申请/专利号CN202010464757.1

  • 发明设计人 孙小强;

    申请日2020-05-27

  • 分类号G16B20/00(20190101);G16B25/10(20190101);G16B40/30(20190101);

  • 代理机构11463 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙);

  • 代理人衡滔

  • 地址 510275 广东省广州市海珠区新港西路135号

  • 入库时间 2023-06-19 08:08:08

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-02-24

    授权

    发明专利权授予

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