ARDGPR模型预测RNA中原子多极距的计算方法

摘要

本发明涉及基于ARDGPR模型预测RNA中原子高阶多极距的计算方法：通过量子力学计算软件Gaussian09优化所有RNA分子小片段的结构，并通过AIMALL软件积分计算分子中原子的高阶多极距；对每一种小分子片段，选择部分小分子片段中各原子坐标位置以及原子的高阶多极距训练ARDGPR模型；并通过剩余的小分子片段构象作为测试集验证ARDGPR模型的预测结果。本发明通过ARDGPR模型预测代替量子力学计算，在基于力场信息的分子力学模拟的基础上，可以快速的针对不同构象给出能量及原子的高阶多极距等物理化学参数信息。同时通过训练好的ARDGPR模型预测原子的高阶多极距，时间少、成本低且预测精度高，方法简便，能够节省大量的人力、物力和财力，为提高RNA分子力场模拟精确度提供相应的基础工具与快捷途径。