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DNA序列中重复区的识别方法和装置

摘要

本发明提供一种DNA序列中重复区的识别方法和识别装置,其中方法包括:对构造的n‑item序列,在DNA序列中识别所述n‑item序列的出现次数;将出现次数大于预设阈值的n‑item序列作为重复区,并构造所有作为重复区的n‑item序列的n‑item序列集合;若所述n‑item序列集合中n‑item序列的个数不唯一,则根据预设规则对所述n‑item序列集合中两两之间的n‑item序列构造(n+1)‑item序列。本发明实施例只需要对构造出的DNA子序列进行识别,识别对象相比现有技术大大降低,其次获得重复区的过程也可以在识别过程中通过统计出现次数获得,识别效率得到了进一步提高,再通过预设规则从重复区中构造更长的DNA子序列,不需要将重复区先与单个碱基组合再逐个遍历整个DNA序列,能够大大提高基因组重复区的识别效率。

著录项

  • 公开/公告号CN108763868A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-11-06

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中南大学;

    申请/专利号CN201810305435.5

  • 发明设计人 李敏;刘莉娟;廖兴宇;王建新;

    申请日2018-04-08

  • 分类号

  • 代理机构北京路浩知识产权代理有限公司;

  • 代理人王莹

  • 地址 410083 湖南省长沙市岳麓区麓山南路932号

  • 入库时间 2023-06-19 07:08:01

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-11-30

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/22 申请日:20180408

    实质审查的生效

  • 2018-11-06

    公开

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