棉花全基因组SNP芯片及其应用

摘要

一种棉花全基因组SNP芯片及其应用，所述芯片命名为CottonSNP80K，包含82,259个SNP位点(SEQ ID NO：1‑SEQ ID NO：82,259)，主要基于陆地棉种内SNP变异定制，非常适于陆地棉种内基因分型检测，可大大克服陆地棉种内遗传基础狭窄，遗传多样性低的瓶颈。该芯片可以对陆地棉品种资源进行分子标记指纹分析，品种纯度和真实性鉴定，育种材料遗传背景的分析和筛选、农艺性状重要基因位点关联分析等。同时，该芯片也将有效用于海岛棉等其他棉种的种内及种间基因分型分析。