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提取林木组织或器官RNA的方法和鉴定林木组织特异性miRNA的方法

摘要

本发明提出了一种提取林木组织或器官RNA的方法、林木特异性条形码(barcode)序列设计和鉴定林木组织特异性miRNA的方法。提取林木组织或器官RNA的方法包括:将待处理样品与交联聚乙烯吡咯烷酮(PVPP)进行第一接触,并在液氮条件下进行研磨处理,将研磨处理后产物与Trizol、β‑巯基乙醇和聚乙烯吡咯烷酮(PVP)进行第二接触。利用该方法,避免了因植物组织中富含多糖、酚类、色素等物质而导致RNA提取效率和成功率不高的缺陷,利用上述方法,植物组织RNA的提取效率和成功率显著提高,同时发明人发现,相比于现有技术,节约了约80%的样品用量,极大方便了微量样品的测序;此外,林木特异性barcode序列的使用提高了测序碱基的平衡度,测序产出至少提高5%,且测序质量也会不同程度的提高。

著录项

  • 公开/公告号CN108504652A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-09-07

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京林业大学;

    申请/专利号CN201710252442.9

  • 发明设计人 张德强;谢剑波;张全锋;

    申请日2017-04-18

  • 分类号C12N15/10(20060101);

  • 代理机构11201 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人赵天月

  • 地址 100083 北京市海淀区清华东路35号

  • 入库时间 2023-06-19 06:22:58

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-10-09

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N15/10 申请日:20170418

    实质审查的生效

  • 2018-09-07

    公开

    公开

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