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一种采用果蝇优化算法识别关键蛋白质的方法

摘要

本发明公开了一种采用果蝇优化算法识别关键蛋白质的方法,将蛋白质相互作用网络转化为无向图、构建动态蛋白质相互作用网络、对动态蛋白质相互作用网络边和结点预处理、随机初始化果蝇种群的位置、利用嗅觉搜寻食物随机方向和距离、计算果蝇个体味道浓度判定值、计算果蝇个体的气味浓度值、找出当前种群中最高气味浓度值、利用视觉向食物飞去、产生关键蛋白质。本发明能准确地识别关键蛋白质;仿真实验结果表明本发明在敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、精确率和召回率调和值、精确值等指标性能都表现良好;跟其他识别关键蛋白质的方法相对,本发明采用果蝇优化算法识别关键蛋白质的方法具有一定的优势。

著录项

  • 公开/公告号CN108229643A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-06-29

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 陕西师范大学;

    申请/专利号CN201810111997.6

  • 发明设计人 雷秀娟;王思果;路铖;

    申请日2018-02-05

  • 分类号

  • 代理机构西安通大专利代理有限责任公司;

  • 代理人徐文权

  • 地址 710062 陕西省西安市长安南路199号

  • 入库时间 2023-06-19 05:48:18

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-08-17

    著录事项变更 IPC(主分类):G06N3/00 变更前: 变更后: 申请日:20180205

    著录事项变更

  • 2018-07-24

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06N3/00 申请日:20180205

    实质审查的生效

  • 2018-06-29

    公开

    公开

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