基于网络指标差异分析的食管鳞癌标记物的识别方法

摘要

本发明属于生物信息学技术领域，涉及基于网络指标差异分析的食管鳞癌标记物的识别方法，包括以下步骤：对食管鳞癌基因样本数据和正常基因样本数据进行处理，构建食管鳞癌基因相互作用网络和正常基因相互作用网络；运用网络模块识别方法，在上述两个网络中找出关键社团结构，对关键社团结构进行基因功能富集分析；提取上述两个网络中的相同节点，并保留与相同节点相连的节点，得到简化的上述两个网络；利用全局指标和局部模块化指标，分析简化的上述两个网络，得到与食管鳞癌相关的基因；结合基因功能富集分析结果及基因注释和功能参考，最终确定食管鳞癌诊断的候选标记物。本发明进一步地完善了基于基因网络差异分析来研究食管癌标记物的方法。