基于DNA甲基化数据考虑纯度效应的差异甲基化分析算法

摘要

基于DNA甲基化数据考虑纯度效应的差异甲基化分析算法，其特征在于，按步骤包括如下：(1)数据的搜集与预处理。(2)肿瘤样本纯度估计。使用InfiniumPurify估计肿瘤样本纯度。(3)差异甲基化分析。所述的差异甲基化分析是把肿瘤样本纯度作为影响差异分析的因素，建立线性模型，利用线性模型中参数估计的统计量开展差异甲基化分析。本发明以机器学习和生物信息学方法为工具，通过肿瘤样本和正常样本的Illumina Infinium 450K DNA甲基化数据进行纯度矫正的差异甲基化分析。