用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记及其应用

摘要

本发明公开一种用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记及其应用。该SNP标记包括48个SNP位点，为SNP1～SNP48，并分别表示其位于SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：48所示的核苷酸序列的第151位。本发明采用生物信息技术的优势开发出能用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记，对于评估食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入水平，SNP标记的应用可大大降低成本和简化操作。SNP标记应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的，从而促进食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的标准化进程。

说明书

技术领域

本发明涉及利用基因组生物信息分析技术的优势，具体涉及一种用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记及其应用；筛选出48个SNP标记，用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象的评估。

背景技术

目前国内生物医药产业迅猛发展，实验动物作为生物医药产业的重要支撑条件及生命科学研究的重要材料，其质量直接关系到实验结果的可靠性和真实性。实验动物的遗传质量是实验动物质量好坏的重要因素之一，只有应用遗传特性稳定的实验动物才能保证生物医学研究结果具有可比性及实验结果的可靠性。因此，实验动物质量标准化，尤其遗传质量的标准化将直接影响生物医药的研发水平。但由于缺乏统一的、标准化的遗传质量控制标准，实验动物的遗传质量监控也渐渐成为其生产应用中较突出的问题。就目前情况而言，筛查到国内外广泛认可的有效遗传标记是实现实验动物遗传质量监测技术突破的有途径之一。

目前，我国实验动物遗传监测主要推行国家标准(GB 14923-2010)，主要采取形态学(毛色基因测试法)、数量遗传学(下颌骨测定法)、免疫标记基因检测法(皮肤移植法)以及生化标记基因检测法等。这些方法各有优势，而且在实验动物的繁殖生产和日常监测管理工作中仍有至关重要的使用价值，但随着实验动物科学和分子生物学的飞速发展，传统的检测方法包括国标力推的生化标记基因检测法、皮肤移植法和免疫学检测法已不能完全适应多种品系实验动物的遗传监测工作。

随着DNA指纹技术、随机扩增多态性(RAPD)、微卫星和单核苷酸多态性(SNP)等一系列分子遗传标记的发现，微卫星和SNP标记脱颖而出，已经大量应用于实验动物的遗传检测，其中，SNP标记是继生化标记和RAPD遗传标记之后的第三代DNA分子标记，具有位点丰富、遗传稳定、筛选规模化等显著优点。然而，相比于目前先进的分子检测技术及国际同行的领先程度，我国的遗传监测标准还有待改进，且刻不容缓。

发明内容

为了克服现有技术的缺点与不足，本发明的目的在于提供一种用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记。该SNP标记能用于评估印度支那地区起源的食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象。

食蟹猴(Macaca fascicularis)是生物医药研究中常用的灵长类动物，其自然分布区域在灵长类中仅次于人类及恒河猴，主要分布于亚洲东南部国家。地理毗邻使包括印度支那地区在内的东南亚大陆食蟹猴的遗传差异最小化，但伴随着板块相互作用导致的岛屿形成，长期隔离与始祖效应促进了菲律宾和毛里求斯食蟹猴与其他岛屿群体的遗传分歧，而印度支那地区的食蟹猴通过与恒河猴杂交使得恒河猴的基因广泛渗入，增加了大陆食蟹猴的遗传多样性，同时加剧了其与岛屿群体之间的遗传差异。食蟹猴疟原虫是传播于食蟹猴群体中最常见的疟原虫之一，实验表明，恒河猴对疟疾的感染比食蟹猴更敏感，与恒河猴有着长期杂交历史的印度支那食蟹猴可能比岛屿种群更易感染疟原虫，所以，了解作为某些疾病实验研究对象的食蟹猴的起源地区及恒河猴遗传渗入水平十分重要。因此，本发明旨在利用生物信息分析方法筛选出食蟹猴的48个SNP标记，用以评估印度支那地区起源的食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象。

本发明的另一目的在于提供所述的用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记的应用。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

本发明首先对已有的23000个共同存在于印度和中国恒河猴中的SNP进行筛选，利用生物信息学方法从中筛选出了384个频率最高的SNP，然后，利用这384个SNP对来自5个不同地理区域[柬埔寨，三宝颜(棉兰老岛，菲律宾)，南苏门答腊(巴邻旁，印度尼西亚)，毛里求斯和马来西亚]的25只食蟹猴进行基因分型，并从中挑选了48个频率最高且仅存在于印度支那(柬埔寨)食蟹猴中而不存在于另外四个区域食蟹猴中的SNP(admixture panel)。最后，利用这48个SNP对食蟹猴及参考样本进行分型，用STRUCTURE评估其恒河猴遗传渗入比例，并验证渗入比例与感染疟原虫发生率的相关性。

所述的48个SNP位点为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15、SNP16、SNP17、SNP18、SNP19、SNP20、SNP21、SNP22、SNP23、SNP24、SNP25、SNP26、SNP27、SNP28、SNP29、SNP30、SNP31、SNP32、SNP33、SNP34、SNP35、SNP36、SNP37、SNP38、SNP39、SNP40、SNP41、SNP42、SNP43、SNP44、SNP45、SNP46、SNP47、SNP48；

所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(T/A)；

所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP8表示该SNP位点位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP9表示该SNP位点位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP10表示该SNP位点位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP11表示该SNP位点位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；

所述的SNP12表示该SNP位点位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP13表示该SNP位点位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；

所述的SNP14表示该SNP位点位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP15表示该SNP位点位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP16表示该SNP位点位于SEQ ID NO：16所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP17表示该SNP位点位于SEQ ID NO：17所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；

所述的SNP18表示该SNP位点位于SEQ ID NO：18所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP19表示该SNP位点位于SEQ ID NO：19所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M(A/C)；

所述的SNP20表示该SNP位点位于SEQ ID NO：20所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；

所述的SNP21表示该SNP位点位于SEQ ID NO：21所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP22表示该SNP位点位于SEQ ID NO：22所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP23表示该SNP位点位于SEQ ID NO：23所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP24表示该SNP位点位于SEQ ID NO：24所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP25表示该SNP位点位于SEQ ID NO：25所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；

所述的SNP26表示该SNP位点位于SEQ ID NO：26所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP27表示该SNP位点位于SEQ ID NO：27所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP28表示该SNP位点位于SEQ ID NO：28所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP29表示该SNP位点位于SEQ ID NO：29所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP30表示该SNP位点位于SEQ ID NO：30所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP31表示该SNP位点位于SEQ ID NO：31所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP32表示该SNP位点位于SEQ ID NO：32所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP33表示该SNP位点位于SEQ ID NO：33所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP34表示该SNP位点位于SEQ ID NO：34所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP35表示该SNP位点位于SEQ ID NO：35所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；

所述的SNP36表示该SNP位点位于SEQ ID NO：36所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP37表示该SNP位点位于SEQ ID NO：37所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP38表示该SNP位点位于SEQ ID NO：38所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；

所述的SNP39表示该SNP位点位于SEQ ID NO：39所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP40表示该SNP位点位于SEQ ID NO：40所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(T/A)；

所述的SNP41表示该SNP位点位于SEQ ID NO：41所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP42表示该SNP位点位于SEQ ID NO：42所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP43表示该SNP位点位于SEQ ID NO：43所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP44表示该SNP位点位于SEQ ID NO：44所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP45表示该SNP位点位于SEQ ID NO：45所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP46表示该SNP位点位于SEQ ID NO：46所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；

所述的SNP47表示该SNP位点位于SEQ ID NO：47所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP48表示该SNP位点位于SEQ ID NO：48所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的48个SNP位点所在的DNA片段，其序列分别如SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：48所示。

所述的48个SNP位点可应用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象的评估。

所述的48个SNP位点在制备试剂盒或检测方法中的应用；所述试剂盒或检测方法的用途为食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象的评估。

所述的DNA片段在辅助进行评估食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象中的应用。

本发明相对于现有技术，具有如下的优点及效果：

本发明采用生物信息技术的优势开发出能用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记，对于评估食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入水平，SNP标记的应用可大大降低成本和简化操作。SNP标记应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的，从而促进食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的标准化进程。

附图说明

图1是群体1(58只中国恒河猴)、群体2(390只印度支那起源的食蟹猴)、群体3(37只马来西亚/印度尼西亚食蟹猴)的恒河猴遗传渗入评估(K＝2)。

图2是Logistic回归模型预测有恒河猴遗传渗入的食蟹猴感染食蟹猴疟原虫的发生率。

具体实施方式

下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述，但本发明的实施方式不限于此。

实施例1

1、实验动物样本

来自5个不同地理区域[柬埔寨，三宝颜(棉兰老岛，菲律宾)，南苏门答腊(巴邻旁，印度尼西亚)，毛里求斯和马来西亚]的25只食蟹猴；390只印度支那地区起源的食蟹猴；58只中国恒河猴；37只马来西亚/印度尼西亚食蟹猴。

2、动物血样来源：蓝岛生物技术有限公司

3、SNP的筛选过程

首先，从已有的23000个共同存在于印度和中国恒河猴中的SNP进行筛选，利用生物信息学方法从中筛选出了384个频率最高的SNP。

然后，使用印度和中国恒河猴中共有的384个频率最高的SNP基因分型了分别来自5个不同地理区域[柬埔寨，三宝颜(棉兰老岛，菲律宾)，南苏门答腊(巴邻旁，印度尼西亚)，毛里求斯和马来西亚]的25只食蟹猴，之后我们又从中挑选了48个频率最高且仅存在于印度支那(柬埔寨)食蟹猴中而不存在于另外四个区域食蟹猴中的SNP，构成了目标SNP(admixture panel)。

所述的48个SNP位点为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15、SNP16、SNP17、SNP18、SNP19、SNP20、SNP21、SNP22、SNP23、SNP24、SNP25、SNP26、SNP27、SNP28、SNP29、SNP30、SNP31、SNP32、SNP33、SNP34、SNP35、SNP36、SNP37、SNP38、SNP39、SNP40、SNP41、SNP42、SNP43、SNP44、SNP45、SNP46、SNP47、SNP48；

所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(T/A)；

所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP8表示该SNP位点位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP9表示该SNP位点位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP10表示该SNP位点位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP11表示该SNP位点位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；

所述的SNP12表示该SNP位点位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP13表示该SNP位点位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；

所述的SNP14表示该SNP位点位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP15表示该SNP位点位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP16表示该SNP位点位于SEQ ID NO：16所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP17表示该SNP位点位于SEQ ID NO：17所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；

所述的SNP18表示该SNP位点位于SEQ ID NO：18所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP19表示该SNP位点位于SEQ ID NO：19所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M(A/C)；

所述的SNP20表示该SNP位点位于SEQ ID NO：20所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；

所述的SNP21表示该SNP位点位于SEQ ID NO：21所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP22表示该SNP位点位于SEQ ID NO：22所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP23表示该SNP位点位于SEQ ID NO：23所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP24表示该SNP位点位于SEQ ID NO：24所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP25表示该SNP位点位于SEQ ID NO：25所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；

所述的SNP26表示该SNP位点位于SEQ ID NO：26所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP27表示该SNP位点位于SEQ ID NO：27所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP28表示该SNP位点位于SEQ ID NO：28所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP29表示该SNP位点位于SEQ ID NO：29所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP30表示该SNP位点位于SEQ ID NO：30所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP31表示该SNP位点位于SEQ ID NO：31所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP32表示该SNP位点位于SEQ ID NO：32所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP33表示该SNP位点位于SEQ ID NO：33所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP34表示该SNP位点位于SEQ ID NO：34所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP35表示该SNP位点位于SEQ ID NO：35所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；

所述的SNP36表示该SNP位点位于SEQ ID NO：36所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP37表示该SNP位点位于SEQ ID NO：37所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP38表示该SNP位点位于SEQ ID NO：38所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；

所述的SNP39表示该SNP位点位于SEQ ID NO：39所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP40表示该SNP位点位于SEQ ID NO：40所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(T/A)；

所述的SNP41表示该SNP位点位于SEQ ID NO：41所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP42表示该SNP位点位于SEQ ID NO：42所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；

所述的SNP43表示该SNP位点位于SEQ ID NO：43所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的SNP44表示该SNP位点位于SEQ ID NO：44所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；

所述的SNP45表示该SNP位点位于SEQ ID NO：45所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；

所述的SNP46表示该SNP位点位于SEQ ID NO：46所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；

所述的SNP47表示该SNP位点位于SEQ ID NO：47所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；

所述的SNP48表示该SNP位点位于SEQ ID NO：48所示的核苷酸序列的第151位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；

所述的48个SNP位点所在的DNA片段，其序列分别如SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：48所示。

4、分型及评估

利用这48个SNP对三个群体(58只中国恒河猴、390只印度支那起源的食蟹猴、37只马来西亚/印度尼西亚食蟹猴)进行分型，并用STRUCTURE评估其恒河猴遗传渗入比例。如图1，结果显示这些起源于印度支那地区的食蟹猴都有一定比例的恒河猴遗传渗入，而在马来西亚和印度尼西亚食蟹猴中则完全不存在。另外，如图2及表1，验证了食蟹猴的恒河猴遗传渗入比例与感染疟原虫发生率的相关性。

表1不同恒河猴遗传比例的食蟹猴的食蟹猴疟原虫感染率

上述实施例为本发明较佳的实施方式，但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制，其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化，均应为等效的置换方式，都包含在本发明的保护范围之内。

SEQUENCE LISTING

<110> 华南理工大学

<120> 用于食蟹猴中恒河猴遗传背景渗入现象评估的SNP标记及其应用

<130> 1

<160> 48

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP1位点所在的DNA序列

<400> 1

cttaagaaaa tgactatttt aagtaaatga gttgagaagc tttagaagat tttcttaaaa 60

tgcaaaaata aaataaagaa tgaagaacaa tgaactgatg actaacatgg agcacagaaa 120

acaagtctaa tgtaagaatg ataagaattc tccaggaaca aaacaaatga acaacaacaa 180

agaataaaag aatacaattg taatacaaaa ataaaatcag aaacaaaatc accattcttt 240

ttgctgaaaa ataaaactct ctcttagaca caattgaatt gataaaaagc aaaattttgc 300

a 301

<210> 2

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP2位点所在的DNA序列

<400> 2

ttgtgaaatg ataggagaca gaaacactac ataacaacaa tctttcacat ctgtgaaacg 60

taattcttca aactactttc ttatctgtta agtcataatg ctcagcacaa tattctgagg 120

tgaatagaat atttccacca tgttttcctg gcgtataaaa cagcaaggtg aattatgcta 180

tgaggctgtg aaggatgaga gcagagggag gaaagaagac gactgacact tttagagctc 240

ctagtatata atagattcat gttaggtacc tataatcaat aagcaaattg cttacaaatt 300

c 301

<210> 3

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP3位点所在的DNA序列

<400> 3

tcagggaaac catgctactc caaataaaca cagagtcaat taaacatgtg cctttgatgt 60

ggaaagctca ggacctccac actactcttc tggggttagg tcagaggtaa aggtgcagat 120

ggatacctcc ttccctgagg actctgccta tgacagtagc agtggttgtt gcaacggtcc 180

tttccccacg gcccatgctg ggttctggca ggcggtgttg catgcttcct ttgcaatgtg 240

gatcgactac agcacacagg attaggatgg gatgaagtct taaaaaccat gtcttctagg 300

c 301

<210> 4

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP4位点所在的DNA序列

<400> 4

ctggttggga actgacactg tcccagctgt aactttccag actgcagtgc accaggaagg 60

cagcatttgc tggagcagct tgtctctgaa ggaggataaa aaaacatggg gctgtggagg 120

aaaggagggc cctgccagct gatgggagtg ctttgtgggg aggtgcctcc accctcctct 180

gcagtggctc ttggcagcct ccatctcaga cactaatccc tgggaaccca gggggcacac 240

tgggaagtag agagaaaaca aagtgaacag tttgagctaa acccaggtca gcaggtggct 300

t 301

<210> 5

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP5位点所在的DNA序列

<400> 5

gattccaggt gtaccattct ttccctgggg aaagcagtca ttcttcaagg caagagatgc 60

aagaatgagc tcatgtcaaa tgatattttc tgattttttt cctccagatg tggggatcca 120

aatcggatct tgtgcttttg ggtgctaact ctgagtcttc ttcctttata tctaaatgac 180

aatttgtgga tcaatgagga tgtgtcaact agcaagattg aggacctgga gggatgctct 240

gtggaaactg ctttaaaatc attcagaggg agggcacaga gctctggttc tggtatgttc 300

a 301

<210> 6

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP6位点所在的DNA序列

<400> 6

cacagtccaa gtaacaagga tagcaccaac aataaacaat tatgatattg tctttgttaa 60

gccaaataaa ctgatctcat taatgtcaaa atatttattt caatgctaaa gttactattg 120

aaccactaat tgataataat gaaataatgt ttgtagcact ctgctgctgt tcacttatca 180

gcttagtgac acaacttaag tagcaaatct gattgcagtt ttcatgcttg ctcttttttc 240

aacagtagag ggcagcacag ctatttttaa gtgtcttctt tgggagccat ttgtgtgtgc 300

a 301

<210> 7

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP7位点所在的DNA序列

<400> 7

ctataacata aatatttaaa aatgaaataa acatgtcaca gataacagtg atagctaatt 60

tattgactct tgagtagcac tttgcatgga ttatccaagt tttaggaatt ttagggtctt 120

aggcatatgt acattacttc atagcagtga gagcccttgt tttaataaaa aggggtttgg 180

tatagtcgtc ggggggtact gtagttattg ttttaaaatc ttcctatttt cccgtcagac 240

tctatacaga taaatataac aagtgaagtg agttcaccac ctactaggta ctggtgtgaa 300

a 301

<210> 8

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP8位点所在的DNA序列

<400> 8

gctttaatga taaacacaat tactattcag catctcacat ttaacccaaa attgggtctt 60

ccttctgatg gtagccttca tgaattggta aatttattct ctagattgga gcaaaaatac 120

ttgctttggc attggataat aggcctcata aaagaattga gacttaaaag tagtaaaaag 180

tgttaaatac atgattgcat ggttttaaat tttgcattgc aggctaactt caattttttc 240

tgcattgtta aggttaatgc tttggataat cttggtcaga cttctctaca cagagctgct 300

t 301

<210> 9

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP9位点所在的DNA序列

<400> 9

ttcagactat gcaggcttgt acacacacac acgcacacac acacacacac acacaccaca 60

ccctgtaatg catattggtc ccatctgctc agatgcagat atcttcccct gggaactcct 120

gtggcacata cgcccatgtt tagacctgca catgtgtgcc cagtgactgg acctggtaca 180

ctgcatgaag tcctgcatga agtttgctat tcctagagga atcccttcct aagcctggag 240

cccccttatc ccagaggaaa gcctccagct cccgctccta cctgagagca gcagggaaag 300

a 301

<210> 10

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP10位点所在的DNA序列

<400> 10

tacaacagtt aagctaaact ttgttggttc aatgcccaag atctggcctg agctttgtat 60

ttggccgtct ggttttcctt caccctcgtc tttagctttc ccagagggga atagaaaact 120

actgaagcag cctccaccag agctctctct tctttgataa tgaaattcca atcagttttc 180

tcagactgct gagaaataca gtcaaatggg agcatcctgg ggtgggtgga aaatacaaaa 240

aacctgagac tttaggcctc tatctggaac aagtacagta gaggagccga aaactccatg 300

g 301

<210> 11

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP11位点所在的DNA序列

<400> 11

aatgaattgt actgcgtgac cttgggcaaa tcaaatatgg cacttcttca atctataaca 60

ttgtgataaa tgtatctaaa tggaatttta tcaacttata cccagagtat atttcagtga 120

agttcatacc aatattctct ggacccctgc gatctggaac ctgcttcccc agggagttag 180

cactcttacc ctcctctttg tccctgctcc acaggtctgt ctgggcaaaa tcgtcaagtc 240

aggtgacttc tttttggagc catcccacct tactttccaa ctctgctttg gtcttggaaa 300

t 301

<210> 12

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP12位点所在的DNA序列

<400> 12

aatttactac atatattacc acatgttttc ctgttatctt aaattgttag caatatcttt 60

atgaaaaatt ttgaggtcag gaattctcct taggcagagg gaagatgtct gaagataaag 120

acagcttaaa gcagagaaga taagcaatgg gagtggggct ccacctgaag acacaatggg 180

caggcctatt cctaaaagac catcaggcag tcaggtaagg ggctatgaag gagtatgtgt 240

tctaggcaaa atgcaagatt agtaaattta tcaaagtcag tacagaagaa attattttgt 300

t 301

<210> 13

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP13位点所在的DNA序列

<400> 13

ttccgtcctg agttggttat ctgttgcctt tcagatctct tcactgcccc ctctatgcac 60

atgcaaactt atttatcctt attttatgca atcgaattca cactttgaca aaatgattta 120

acaacaaatg cttgcctaag gtaagatata tttgttttaa acagttttgt atctccttgt 180

gacttcaaag agttagtaga attctaattt gctgaaagca tttcagattt cagatgagct 240

gtggattaga aaagcatagt agaatgattc agttgccttg gcaggaaaaa ttcacttaat 300

t 301

<210> 14

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP14位点所在的DNA序列

<400> 14

cccagatctg cagccagtaa ataatgaaat ctggtttcct ttccaggcag cttatcttca 60

gaacctaggt gtttaacacc tttgatagtg tctaaagcac ctatcagagg acatgttacc 120

ttgtgagtgc ttaaaaatgg cgatgatggt cgtcttttca tagttttctt tattgtcatt 180

gctgcttttt tccagaaccc agtttttaga aggctttgcc tcttgacctc ttcttaatgg 240

gatccctgca tgaagtgaca agcagtggca cctgcttgcc cagtagaaca gccaccctgg 300

g 301

<210> 15

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP15位点所在的DNA序列

<400> 15

gttttatcaa tgtgtcaacc atctaactct tttattatta ttttgtgggg ggaatggtgc 60

ttctctctaa attctgtatc ttaccatagc ctgaatatga gacagaccta cacaaagcaa 120

acactagtcc aatccagtag cctcagcaag attctttgct ggtttctgct gcaagatggc 180

cagatttgct ggttatctca gttgttaatg gctatggtgc aactggtccc gatgggccct 240

ttggggtcct gacatttcta ccagagcaca tgtacctggc tttttgcccc agtttcagca 300

c 301

<210> 16

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP16位点所在的DNA序列

<400> 16

aaaggattct aaaaatgcaa acctgagagt gtgtgatgat gtagaatata ttatcacatc 60

acatatccag ctttgctgaa gaacagggtg ttctacacaa tacgaggcat tgaatataat 120

tgaatcctac gccaatactg atttgtttgg catttgagtc tgatttcaag tgggaaaata 180

gatgtgttgt ttgtaaaact tatgaattaa taagttctga gaatcaaaag gactgacctc 240

aaacaaattc atgaaattat atttactctt atttctgtct tagtcttgga gagttgacgt 300

t 301

<210> 17

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP17位点所在的DNA序列

<400> 17

cgaaacgaac taacaaactc cctcaaagca agacacaccc atctgttcaa ctgccagaca 60

ctgttccagg cgctcgtacc caggtaaact ggtagtgtcg cgcaggtcat ttccagggac 120

cttaccctgg attcccctgc tcgctcaggt ctaagtcccc agacacccca gtcccatcct 180

cggctgttct agactccaga atgcgttcct tagcgaaggc tgagaacctt ttaattcgct 240

ctcagtcaac accaaagacc ctcaagcaaa ggctggagct cccagccatc ttcggaaaaa 300

c 301

<210> 18

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP18位点所在的DNA序列

<400> 18

tgagctgtgg ctgcagtggc cacatctccc catttcaaga gaaccgtgca tcctgatttc 60

aatttgtaaa cattaaaaac atgatagaca cagacaaaac acaactccag gcccacagcc 120

aaccctctgg gcaccatttg gccaactcca tacccttttc ctttgctcct gtgctgtttt 180

gatggcttgt tttatcctcc tcacgaagct gtagagttct tgaaacaagg accgtatctc 240

acacagcttt catctccttc caggtaacaa cagtgctggc tgggagtaag tgatggtgcg 300

c 301

<210> 19

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP19位点所在的DNA序列

<400> 19

tcataattat aatgtggaga cttgcatgta tatttttaaa agggtcaaat ttagaaagct 60

acagagcaga gaaaataata agaaagagcg tttctgactt cgttgcaagg tagacaggca 120

ggaagtctgc atttctgaag aagagggata atttaataac aacgtgatcc tgacattcat 180

tttcctcagc agggcttggt ctttggattg acatctgaaa tgccttcccc atcactgaat 240

gtgaaggtgt atgtcagagt agagggaaat tatagcctgt tatagagtga ggaacagaga 300

t 301

<210> 20

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP20位点所在的DNA序列

<400> 20

tgtgtacaca cacccatata ttattaaaaa tgaattatca tattagtttt agactacatt 60

atcaaactac tattgctgaa tacaaggtaa gattatcaaa taatgcaaca tcacatatac 120

agacacacca acattggcta acaataactt atacatgtga agttgtatgt aattatttta 180

ttataatcat aatgatataa ctcaaaatag tttgtaaaac aagttgtaat aattgccttc 240

aatatctgtg tttcattttg gagaaaatat tctttcttag tggtacccaa attattatta 300

c 301

<210> 21

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP21位点所在的DNA序列

<400> 21

ttgtgatccc tacctacaat gctgcattga taaaattgcc tccttagggt tttgacatag 60

gaaatggaag tattagtgtg aatgtacagc taagcatctc tctatcgagc ctctccgtca 120

gacaatgggg ggcctaagag catagtgccg agtgatatga tcagcgatgg ctgaaatcag 180

aagcaacttc aagtttgact gatcaaactg aattagttgg ctcaagatcc agcagctagt 240

agaaagtcct cctcttggtg aacggttgtt ttcttcagac agaaaaagaa tgatgctgtc 300

a 301

<210> 22

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP22位点所在的DNA序列

<400> 22

atctccacaa cttgttctct agatgtctat acatagaagt agttgtacga gaaatcccat 60

aactttacta gaatttacct ttatatggaa gctgagacaa gcactaggaa tcttagtaaa 120

tgtccttggt gactgccaat aactttcctc taacttctgt tcgttgatct atggtcctag 180

ctaaccatga gagtatttct gacttttctc tctgtcacgc atttcatata tctagtgaaa 240

agagtgtgat tgcaacatga tccattgcct caaaacaggt gaccaggact tcccagaaat 300

t 301

<210> 23

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP23位点所在的DNA序列

<400> 23

agcactgtag gtgtctctgc cctcacaggg gacgcctgca caaggaggtg tgaaaagggc 60

tctgcaggag cggggcctgg gctggtgctc gctccctccc ttcatcctac gccagttccc 120

acgcctcttc cggaaggagt gcccggcccc acccggtgaa tcagagccca actctcctga 180

caattggctg tcacttattt aactgccacc atccccagga gacagaaaat gccagagggg 240

tggggcctgg gcagtgcctc ctcgctactt ccccgggtac cgtgccacat tgccttggtg 300

c 301

<210> 24

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP24位点所在的DNA序列

<400> 24

tctgtcacta tctgaaaaga aagaggctgt gggaaacaca gaaatggtat gcattaataa 60

ctgattatag gctgaagaga aaaaaatgta gctgactgca aacccagtgc tgtgagggga 120

cttgtatgag gttccaggtc aaagacaaac cgtgtgagcc agtccagaag ggtgtaagtt 180

ctctgaatat tccttgctga ttgttgggtg acacatgtac cacatactgt ctccatttaa 240

gtcatggttc tactgtagat ttatttttat attagttaat aaatgactta aaatcgtcag 300

c 301

<210> 25

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP25位点所在的DNA序列

<400> 25

gcagaaaact ggcatcatgg gcagggcctg ggcagcctta cagaggctct ctcttattag 60

aggctgcttt tcaatggtca aaaatgtggc tccttggggt gctgggacag gagaaggtat 120

cactggggga cttttctagg gaaggaaatg ttggtgccta gcggccactt cctgggtgaa 180

gccctcccca agtcccacct tcctcctcac ctccaggcag agcaagtggt catcctctcc 240

tccagacttc tggcacgctc agcccatatt attcacaatg acagctccta tattgagcac 300

t 301

<210> 26

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP26位点所在的DNA序列

<400> 26

ttctcgcaga cttcaaactg ttaaaggtaa ctagaggtga ctgaccaaat taggtcaggc 60

aataaatgag aaatatgttt aatcttagca cgattttcca ctctgttttc tgttttgttt 120

cataggtgga gggtagttaa atatatgtct actttgagtt tgaaaataca ctttaggaat 180

tgtatcttat cagtaagtgc tttacaaaca ccatttatta tctgatttga aatattgcta 240

atctatttga acaatcccgt ttatcaaaag tatgtcaagg aaattttgtg ccatatatga 300

a 301

<210> 27

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP27位点所在的DNA序列

<400> 27

cttgcaaaga catataagct ccatttcgca agggtcatta gaaacaactg aaaaaggaaa 60

tattaaattg gcaaagcgta caggtctaca ggagtcccct gtaccttcga tgtgaaggtt 120

cagttaatat ctggcatcat ttcttgtttt gaattttaca atttgcatca tgagaacact 180

gacacttaat atttgctcaa aaaatgttaa acggaaggag ggagggcagc ccctcaagaa 240

aagccccaag atccagtgat cacacaggcc caggctaaac ttcagcatcc tgaaatcctc 300

t 301

<210> 28

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP28位点所在的DNA序列

<400> 28

cacactcagt cagaaggact gagtggccct atgcattcag catgtggcag agactataat 60

ccatttattc aaaatgtctc atcttgcaaa aaattcaatt tgagccatca ttagattctt 120

ccatacattt ctaaatttgc ctttatggca tctccattgt gaagtctttt ataaagttct 180

ccttttcttc atagtctatt ccaaacacct gaattcccat tttctccttg gttttgtgtt 240

tctgcattgt agaattgaat tgagtgactt ttgagttaca aagcccacac tctcttcatg 300

a 301

<210> 29

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP29位点所在的DNA序列

<400> 29

ggaggaaatg gccttggaat ttttccttgc ttttcactat gtcccccata gtgtttgtct 60

aaaacagcaa accccattgt attattgtgt ccatgaccaa gaggacaggg atgccttttg 120

tgtccctaga gttgggggat cctttacctc gtggtgaccc cagtgaccat ggttcccaca 180

ccatgtgcct cagcctggct gccctgtaat gtcctcttcc tggagccagt acatttccac 240

taaatccagc aagcgtatgg acaatttcct tggtggcata tagttattac tcagattttc 300

g 301

<210> 30

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP30位点所在的DNA序列

<400> 30

ctatactttg ctttaccatc tactatctcc caaaggcaac attctctttt tctagaagaa 60

aacagaatat aaatccatat gaagcaaaga gtcctgtcca aatctcagga cctgctcttc 120

agagacaata gatcaccatc atttgttgga atgtttgata cttttgtggt tcattcagag 180

acaaaactct tctctgtttg aaaccctgga aatgactttg tcccaaatta aattattctg 240

attcagagat gcccttgcat agaattttga ggttgtgcaa cccctcctct gccactcaca 300

c 301

<210> 31

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP31位点所在的DNA序列

<400> 31

atgtggctgg aagaccttac catagtcttc ttactgttca caactgttat tctaactcat 60

tgtcactagg ttcactaata tcaggtggga gaatcgaccc tccctattga caggtcatga 120

cccccaaaca gctcccctgg gggatacagc cgggtaattt ggagcatatt ttctgactaa 180

catcacccac attccttggc tgcagtagtg tctggaagtc agtgcctccg ctgtcatcaa 240

ccatctgtgg actgccggaa gacctacagg caaaggcagg atctgtcttc tatacttctc 300

a 301

<210> 32

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP32位点所在的DNA序列

<400> 32

attatagcca gttctgcagg aaagtcataa acatattcaa gtttgagaat aattagttaa 60

gcaacagcaa aaagttggga gaggatccag ttagctgctc tgactataaa atataaaata 120

ttaacactgt gcttgaaatc aaactgaata cagcagtgtt tttttaaaag cttcattttg 180

attgccacag ccccagacag ggagtgagtg aggcaagtgg aaagaagtat gttctccaca 240

caggcatcag atctgctcag gaaaatgtgc gtgaggaacc tggtgcagaa gtactgccgg 300

g 301

<210> 33

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP33位点所在的DNA序列

<400> 33

aaacaccctc tggcaccaga agggctgggc accagaaaac tatgaagaca cctggaggag 60

gaaggatgca caggggagat tataggtcat ccttgtggac aggtgagaat gtggtcagga 120

ctgtgtcagg cagagttaaa ggtggaggcc ggagacgcaa atatcggatt ctctgtgttg 180

aagttctctg tgccatgtca actgggattt aggaggctgg aatctgcaat ccctaaccac 240

atggcaagat ctttttcaga acttttttgt ttcacattac agtgctgcta ctaaatcaat 300

a 301

<210> 34

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP34位点所在的DNA序列

<400> 34

ctctcttgtt tcaggccaac atgtttctgg ggaaggggca ttgagttctt tcacgcttca 60

cagtggttga cagcaaagct ggggacctct gacaaaagaa ttgcttttat ttgcactcat 120

gagatgggtc tggaacactc aagaaaacct gtgactccaa acgctaccag ctggagctgg 180

gggactccct tccagagagc attgatggct ctgaagggcc atgggcagac cagtgagaga 240

gacttaccag agatttttgc ttttggaaat gaatctgatc ttaaggaaaa ggcaactgcc 300

c 301

<210> 35

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP35位点所在的DNA序列

<400> 35

ggatggcaac tcagatttag acaagtgttt ttcccacttt ccataggcgg tagatgtggc 60

aaaaagatgg ccgtttaaga gggctggaga cagcctctga ccactcatag actgtatgat 120

tatggtcaag acactgggaa ctttctgggc cttgctccac caccccttca taaaagaagt 180

tgatgaagtg ataaacaata gttcctcctc acttgtaatt gtatcagaaa actgaagcta 240

ttagggatct taaagttcat ctagccccag aatggcaatt cagcattatc ttagatactg 300

a 301

<210> 36

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP36位点所在的DNA序列

<400> 36

gcttgaaaat actctctgta ttccactctg atttcaaggt tacctaatct tgttgagggt 60

taaatttaaa aattttaaat cgaaaggtgt ttgagtttgt atgttgtagg ttattacaga 120

gaaaaagcca cttacactaa gatttaaacg cgcaggaata tgggtatggc gtcttctaac 180

gtggcctctc tgtggcatga aaaactgcac ctgaaaacct ggaaaacacg ttcctaaata 240

ccagttacac ttgcgccctc actcactgtg catgcccggg gtcctgtgct gatgggcatt 300

c 301

<210> 37

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP37位点所在的DNA序列

<400> 37

atttcagggt tcacattcat gaggtcaaag aactctgtgg actgcaggaa gccaagagaa 60

tgaattcaaa catttccggg ataatgtaaa tttatcggct taaaacagtt ttttcagtta 120

ctttcataaa taaacataac agccattgaa cgtgctgttg cttactagta ttacagaaac 180

ataagagata aggattagtt tgatttaagc agaaaagtga acctggtctc catgtttctt 240

aaaatctttt gcaccttctt gccacaagcc tgaagttgaa tcacgattaa atccttcctt 300

g 301

<210> 38

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP38位点所在的DNA序列

<400> 38

aaaacttaaa aaacaaaaaa aaacaagtaa taagctgggg aaaatatttg tcactcctct 60

cacaggccca gggggcagag ctggttcctc ctcacgtttt tgttctgcct cctctttctt 120

ctttgaggtg atctcggagc atcataccca ccttcaatca tgccgtgttg agtcggggag 180

atgggggaag gttaggtcat agattcctat gtctagtgtt gggtcacctc acccatacca 240

cctcctctct tcatctcatg catgaagaac aagaaataag atgttccatc acgataaata 300

g 301

<210> 39

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP39位点所在的DNA序列

<400> 39

gtgatgtcag ggcatctctg gaaattcagg gaggggcagg ggaaaggatt gggaatccct 60

tacgtatcgc ttcccattta tacaggtggc agatgagtca gattctggct gctgtgttac 120

ggagaaggga attgcctgta actgagttgc aagtgctcgt acaaatgtta agcaggccag 180

ctgtttacag agtttgaatt cagctccctc tcgcagacag aatcatccca gcctgttggc 240

atgtctgggg tctataggat tgtctcctcc tcttgatctg aaaacatgct cagattgggg 300

t 301

<210> 40

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP40位点所在的DNA序列

<400> 40

aaagcaggga taaagagaga catataaatc cattttgctt ttaaaagaag agttaaagaa 60

ctaaaattaa agaattattt ctgtttagct ctggttttct aatgtgatga ctttatttct 120

aaagactgct gtgatgcggg ttacaaagta taaacaaatc tctaggagtg tcacaagaga 180

gcagttcttg ctggctccca gcaccactcc attttcaccc ctgcagggct cagccccttg 240

cttaggatac ccttcctgag tagtccctgc tgtcagactc acaaacaaga agacagagat 300

g 301

<210> 41

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP41位点所在的DNA序列

<400> 41

gtcctgctgt gggaacaggg cgccggccag gtggggcctg tagcccaggg ctgtcttcct 60

gtcctggcag gcacattccc tgagcccaca ctgatagcaa ggttaagtgg accaacctca 120

gggctgagga ggggctgtac tcagtaactg cagttcttaa agatgtttct ttggctccct 180

catgagccac tcaatctact gaaaacctct cggttctctt ccaatcccac tcccctggcc 240

caggggcggt cctttctaat tcctcccacc cacagaccag ccctgataaa tcagcctggc 300

t 301

<210> 42

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP42位点所在的DNA序列

<400> 42

taaatcacta catctgacaa aggcgcacaa agcttaccta cttttcctat tatgcataat 60

atattcagaa tcatctatat agcatccgtt atattcataa tgatttggtt aagtgctata 120

gaagttgcag aggtaaattg ggacttgact ttcggtttac agtttattag aatgtatgac 180

cactataata aacaacaata aaatggacat tttttaagac atagtgggtt acagatgaca 240

agatagtgaa tattttcaac taagaattat tgaaccttta gaaaggtaat aaaaaatcat 300

t 301

<210> 43

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP43位点所在的DNA序列

<400> 43

cagagcagtc tgtagcacat gccaggcact cagtaattgc tcttgcagta ttgcaatatc 60

cctcttcctt cttcttattt ctggttgtag ttgaggtact gactctctga tctcagtgtt 120

atggctggat ggagaaggat tgtgtgtgag gaacatcaaa tagtcatgat gccaatgtgt 180

gccaataatt taagacaact aattgtttca gagtcagaag gagctccttg tggagagctt 240

cgttgttata ttctattcaa ctcagaatgt tttacagacc ttgattttta ggggtatccc 300

t 301

<210> 44

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP44位点所在的DNA序列

<400> 44

cactcttcaa ttaaccggtt cttcctcttg atttttgtta ttttgttagt tacaacaaca 60

tccatccaag cattcttaca tgaaatcttg gaatcatatc ttctcctgtc cttacattca 120

ataaattcct aagacttgta gatttttctt gagaaatttg tttcactttt cttacctcta 180

ttttctctct caccaacctg attcaagacc tcatcatttc ctacctttct ttaactaaac 240

ttcccattag aattctatgc gatttaccag atcaaccatt ctaatcccag tgctggctat 300

a 301

<210> 45

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP45位点所在的DNA序列

<400> 45

acctcagatg atccacctgc ctcggcctct caaagtgctg agattacagg agtgaaccac 60

tgcgccagcc ctacatttgt tttcttaata gtagggaaaa tatacattta tttcttttat 120

gatttttcag agaggtagag ataatagatg caaactcttg gaaggaaagc tgtactgatc 180

taaccaagat attttgtttt tctcatccac cagttccctt ctcagtcctt tctgtatccc 240

ttgcaatttg aacaaagctt ggtgaatagt gagcacataa aaagcatatt aggtgaaaga 300

c 301

<210> 46

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP46位点所在的DNA序列

<400> 46

tgggtcacct ggaccctgtg gagatggcac ccggcctttg gctgcctgtc tcccacccca 60

ccctgagtgt cccgagcact caccaatggc aatgtggaca gacagaacag gctgggccac 120

ggtcagtgcc cagatatgca ggctgtgcag ggcttccacc ccctccaccg acagcagcag 180

atcccgcaca gctgtgaagt ccacgccctt gggggtccct gaggatggca agcacagggg 240

ctaaaggaaa ctgcccctcc cacgcctgcc cattggtaca gggctagctc ctggtcctca 300

g 301

<210> 47

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP47位点所在的DNA序列

<400> 47

tggttccagc agcaggacct cccactccac agtgctaggc caggacgttc agagccagtg 60

tttcccaggt cattttcctt cggtatactg tctgtctgaa tttcccttcc caaatctgca 120

cattgcgcat taatacccca cactcaataa agatctgact aatggcacag cccatttccc 180

atagggggaa cacctctatt tccttctact aaatatatat ctgtaagtgc tttataaact 240

gtaaggtaat ttgaaaggtt cacttgttct acaacataag tagcatttta aatgaacaac 300

t 301

<210> 48

<211> 301

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SNP48位点所在的DNA序列

<400> 48

ctccatacac attgtattat ctaattctca cttattcata caacatcccc catatttgct 60

gccttgcagg tagtttggaa agctttggat ccacagaaat gcacaacttt actgcctact 120

ccctcccctc ccattgctgc ataattcaca ggcacttccc agtgctgatc tggctgaccg 180

taagccacca ataccgtggg ctggaccacc taccttgtct atcaccatga cacaagcacc 240

ctcagcacac acattcagtt ttatgtcagt gataccaaag gtggtaggaa gaacaagtcg 300

t 301