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预测长链非编码RNA和蛋白质联系的方法及系统

摘要

本发明涉及生物信息技术领域,公开一种预测长链非编码RNA和蛋白质联系的方法及系统,以确保预测的准确度,节省实验成本。该方法包括:构建lncRNA‑蛋白质相互联系的子网一、lncRNA‑lncRNA相互联系的子网二以及蛋白质‑蛋白质相互联系的子网三;将各子网组合构造成全局异构网络;确定任意lncRNA与任意蛋白质在全局异构网络中建立联系的至少两条游走路径;任一游走路径将子网一与子网二及子网三中的至少一个进行串联;通过HeteSim算法计算各游走路径的HeteSim分数;根据全局异构网络中lncRNA源端与蛋白质宿端之间的各游走路径的相应HeteSim分数进行用于预测非编码RNA和蛋白质联系的分类模型的构建及评估。

著录项

  • 公开/公告号CN106599610A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-04-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中南大学;

    申请/专利号CN201611085289.7

  • 发明设计人 邓磊;肖云;

    申请日2016-11-30

  • 分类号G06F19/18(20110101);

  • 代理机构长沙朕扬知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人何湘玲

  • 地址 410000 湖南省长沙市岳麓区岳麓山左家垅

  • 入库时间 2023-06-19 02:00:58

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-07-17

    发明专利申请公布后的驳回 IPC(主分类):G06F19/18 申请公布日:20170426 申请日:20161130

    发明专利申请公布后的驳回

  • 2017-05-24

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20161130

    实质审查的生效

  • 2017-04-26

    公开

    公开

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