用于组装来自一个或多个生物体的染色体段的方法、设备和计算机程序

摘要

本发明涉及从代表文库的DNA片段的一组原始子序列组装代表至少一条染色体段的序列，所述文库包括包含连续核苷酸的链的DNA片段并且包括包含连续核苷酸的至少两条链的组合的DNA片段。在获得代表DNA区域之间的接触频率的第一值之后，所述第一值与代表相应DNA区域之间的距离的第二值相关联，迭代地进行以下步骤：‑基于所述第一和第二值并基于将DNA区域之间的接触概率与相应DNA区域之间的距离相关联的理论模型更新基因组结构，更新的基因组结构代表染色体的真实基因组结构；和‑更新作为更新的基因组结构的函数的所述理论模型的参数。