法律状态公告日
法律状态信息
法律状态
2018-05-25
授权
授权
2017-02-08
实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/70 申请日:20160830
实质审查的生效
2017-01-11
公开
公开
技术领域
本发明属于养犬业的病原检测领域,具体涉及一种检测犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析方法。
背景技术
犬瘟病毒(Canine distemper virus, CDV)、犬细小病毒(Canine parvovirus, CPV)、狂犬病毒(Rabies virus, RV)是犬病毒性传染病暴发和流行的几个重要病原体,这三种病毒单一或混合感染后临床致死率可达50%~100%,给养犬业造成严重的经济损失。CDV感染引起的犬瘟主要有呼吸型、消化型、神经型和混合型4种,可引起感染动物全身性的免疫抑制,病死率极高。单一CPV感染机体引起的症状较轻,与其他病毒、细菌协同混合感染,引起的临床症状非常明显,主要引起犬急性出血性胃肠炎和幼犬急性心肌炎。RV是人兽共患传染病—狂犬病的病原体,其感染危害中枢神经系统,病死率几乎为100%,至今尚无有效的治疗药物,是迄今为止人类病死率最高的急性传染病。
目前对CDV、CPV、RV 的临床诊断方法主要采取血清学方法,如ELISA、胶体金快速检测试纸条等,但是非特异性交叉反应而影响诊断结果的准确性,并且该方法的敏感性不够高。随着分子生物学的发展,最近国内外建立了PCR/多重PCR、荧光定量PCR等检测方法。虽然PCR技术具有特异性强、敏感度高的优点,但结果判定需要电泳,费时费力,且反应产物容易产生污染而导致假阳性。荧光定量PCR技术融合了PCR的多种优点,具有更高的敏感性和特异性并且大大缩短了检测时间。建立两重或三重荧光定量PCR方法比较复杂,除了对试剂、引物有特殊要求外,同时也要求仪器有多个检测通道,大大增加了实验难度,并且仍不能满足样品较多但样本量较少的检测需求。目前,尚未见有应用多重免疫荧光分析方法对犬瘟病毒、犬细小病毒、狂犬病毒进行检测的相关报道。
发明内容
本发明的目的在于提供一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析引物。
本发明的另一目的在于提供一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析试剂盒。
本发明的再一目的在于提供一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析方法。
本发明所采取的技术方案是:
一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析引物,所述引物核苷酸序列如下所示:
引物CDV1:AACAGATGGGTGAAACAGCA(SEQ ID NO:1),
引物CDV2:GCATAACTCCAGAGCAATGGGTAG(SEQ ID NO:2);
引物CPV1:CAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTC(SEQ ID NO:3),
引物CPV2:TTGTGTAGACGCCTCAAAAGAATAA(SEQ ID NO:4);
引物RV1:CAGGACTGGTATCATTTACTGGGTT (SEQ ID NO:5),
引物RV2:GAAGTGGATGAAATAAGAGTGAGG (SEQ ID NO:6)。
进一步的,所述引物CDV1和CDV2其中一条引物的5’端被生物素化;
所述引物CPV1和CPV2其中一条引物的5’端被生物素化;
所述引物RV1和RV2其中一条引物的5’端被生物素化。
进一步的,所述引物CDV1和CDV2、CPV1和CPV2、RV1和RV2中未被生物素化的引物的5’端连接有tag序列,所述tag序列能与荧光编码微球中带有的anti-tag序列互补配对。
进一步的,所述引物CDV1和CDV2、CPV1和CPV2、RV1和RV2这3组引物对中连接的tag序列选自SEQ ID NO:7~9所示的tag序列,且该3组引物对中连接的tag序列互不相同。
一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析试剂盒,该试剂盒中含有上述任一所述引物。
进一步的,该试剂盒中还含有链霉亲和素-藻红蛋白复合物、3种编码不同荧光色的荧光编码微球。
进一步的,所述荧光编码微球中还含有与引物中tag序列互补配对的anti-tag序列,编码不同荧光色的荧光编码微球中含有的anti-tag序列互不相同。
一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析方法,包括如下步骤:
1)从样品中提取病毒核酸;
2)以提取的病毒核酸为模板,用上述任一所述的引物进行PCR扩增;
3)将上步扩增产物、3种编码不同荧光色的荧光编码微球、链霉亲和素-藻红蛋白进行杂交;
4)杂交结束后,通过Luminex系统对杂交产物进行检测分析,确定其病原的类型;
上述方法用于非疾病的诊断和治疗。
进一步的,步骤2)中PCR扩增的反应体系为:
5×One-step RT-PCR buffer5µL
dNTP 1µL
引物混合液 4µL
酶 1µL
模板 2µL
ddH2O12µL
Total25µL;
进一步的,步骤2)中PCR扩增的反应程序为:50℃反转录30min;95℃预变性15min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸20s;循环35次;72℃终延伸10min。
进一步的,步骤3)中所述杂交的反应体系和程序为:
3种荧光编码微球20µL
链霉亲和素-藻红蛋白75µL
扩增产物 5µL
总体积 100µL;45℃孵育30min。
本发明的有益效果是:
1)本发明实现了同时对犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒进行检测,本发明通过RT-PCR获得目标扩增片段,再将扩增产物、荧光编码微球和链霉亲和素-藻红蛋白(SAPE)进行杂交,然后通过检测仪读取MFI值时,分辩不同类型的病原。
2)本发明方法能够同时对犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒进行准确检测,而且特异性强,灵敏度高,重复性好。与传统检测方法相比,本发明方法实现了对同一样本中的多种不同目的分子同时进行检测,样本用量少,操作简单、快速,可大大降低检测成本。本发明能保证相同的复性温度和杂交效率,且有效避免不同检测物标记的微球之间交叉杂交。
附图说明
图1是犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒3种病原PCR的电泳图;1:DM2000 DNA marker;2:CDV;3:CPV;4:RV;5:NTC(PCR空白对照);6:对CDV+CPV+RV进行的三重PCR;
图2是犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒3种病原的多重荧光免疫分析方法检测实验结果图;
图3是犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒3种病原的多重荧光免疫分析方法检测特异性实验结果图;图中的“Rabies”即为RV;
图4是犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒3种病原的多重荧光免疫分析方法检测灵敏度实验结果图;
图5是犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒3种病原的多重荧光免疫分析方法临床检测实验结果图,NTC表示阴性对照,PC表示阳性对照。
具体实施方式
一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析引物,所述引物核苷酸序列如下所示:
引物CDV1:AACAGATGGGTGAAACAGCA(SEQ ID NO:1),
引物CDV2:GCATAACTCCAGAGCAATGGGTAG(SEQ ID NO:2);
引物CPV1:CAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTC(SEQ ID NO:3),
引物CPV2:TTGTGTAGACGCCTCAAAAGAATAA(SEQ ID NO:4);
引物RV1:CAGGACTGGTATCATTTACTGGGTT (SEQ ID NO:5),
引物RV2:GAAGTGGATGAAATAAGAGTGAGG (SEQ ID NO:6)。
优选的,所述引物CDV1和CDV2其中一条引物的5’端被生物素化;
所述引物CPV1和CPV2其中一条引物的5’端被生物素化;
所述引物RV1和RV2其中一条引物的5’端被生物素化。
优选的,所述引物CDV1和CDV2、CPV1和CPV2、RV1和RV2中未被生物素化的引物的5’端连接有tag序列,所述tag序列能与荧光编码微球中带有的anti-tag序列互补配对。
优选的,所述引物CDV1和CDV2、CPV1和CPV2、RV1和RV2这3组引物对中连接的tag序列选自SEQ ID NO:7~9所示的tag序列,且该3组引物对中连接的tag序列互不相同。
一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析试剂盒,该试剂盒中含有上述任一所述引物。
优选的,该试剂盒中还含有链霉亲和素-藻红蛋白复合物、3种编码不同荧光色的荧光编码微球。
优选的,所述荧光编码微球中还含有与引物中tag序列互补配对的anti-tag序列,编码不同荧光色的荧光编码微球中含有的anti-tag序列互不相同。
一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析方法,包括如下步骤:
1)从样品中提取病毒核酸;
2)以提取的病毒核酸为模板,用上述任一所述的引物进行PCR扩增;
3)将上步扩增产物、3种编码不同荧光色的荧光编码微球、链霉亲和素-藻红蛋白进行杂交;
4)杂交结束后,通过Luminex系统对杂交产物进行检测分析,确定其病原的类型;
上述方法用于非疾病的诊断和治疗。
优选的,步骤2)中PCR扩增的反应体系为:
5×One-step RT-PCR buffer5µL
dNTP 1µL
引物混合液 4µL
酶 1µL
模板 2µL
ddH2O12µL
Total25µL;
优选的,步骤2)中PCR扩增的反应程序为:50℃反转录30min;95℃预变性15min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸20s;循环35次;72℃终延伸10min。
优选的,步骤3)中所述杂交的反应体系和程序为:
3种荧光编码微球20µL
链霉亲和素-藻红蛋白75µL
扩增产物 5µL
总体积 100µL;45℃孵育30min。
优选的,步骤3)中3种编码不同荧光色的荧光编码微球中还含有与引物中tag序列互补配对的anti-tag序列,3种荧光编码微球中含有的anti-tag序列互不相同。
下面结合具体实施例对本发明作进一步的说明,但并不局限于此。
实施例1 引物
经过对所设计的大量引物进行筛选后,发现引物对CDV1和CDV2、CPV1和CPV2、RV1和RV2对多重荧光免疫检测犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的效果最好,其碱基序列如下所示。
引物CDV1:AACAGATGGGTGAAACAGCA(SEQ ID NO:1),
引物CDV2:GCATAACTCCAGAGCAATGGGTAG(SEQ ID NO:2);
引物CPV1:CAAGATAAAAGACGTGGTGTAACTC(SEQ ID NO:3),
引物CPV2:TTGTGTAGACGCCTCAAAAGAATAA(SEQ ID NO:4);
引物RV1:CAGGACTGGTATCATTTACTGGGTT (SEQ ID NO:5),
引物RV2:GAAGTGGATGAAATAAGAGTGAGG (SEQ ID NO:6)。
本发明采用多重荧光免疫分析的方法对分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒进行区分,故将上述引物作进一步的修饰,以满足相应的操作要求。其中引物CDV1、CPV1和RV的5’端连接有tag序列,所连接的tag序列分别为:
引物CDV1的tag序列为:ATCTCAATTACAATAACACACAAA(SEQ ID NO:7);
引物CPV1的tag序列为:CAAACAAACATTCAAATATCAATC(SEQ ID NO:8);
引物RV1的tag序列为:TACTACTTCTATAACTCACTTAAA (SEQ ID NO:9)。
另外,引物CDV2、CPV2和RV2的5’端还添加有生物素标记。
实施例 2:快速区分CDV、CPV和RV的多重荧光免疫分析试剂盒
试剂盒包括以下组分:
(1)实施例1所设计的用于多重荧光免疫分析的引物;
(2)3种编码不同荧光色的包含有anti-tag序列的荧光编码微球,所述anti-tag序列能相应地与多重荧光免疫分析引物中的tag序列互补配对;3种微球均购自luminex公司,其中CDV、CPV和RV分别对应的荧光编码微球号为MTAG-A067、MTAG-022和MTAG-034。
(3)链霉亲和素-藻红蛋白复合物。
(2)3种编码不同荧光色的包含有anti-tag序列的荧光编码微球,所述anti-tag序列能相应地与多重荧光免疫分析引物组上游引物上的tag序列互补配对;三种微球均购自luminex公司,具体的CDV、CPV和RV分别对应的荧光编码微球号为MTAG-A067、MTAG-022和MTAG-034。
(3)链霉亲和素-藻红蛋白复合物。
实施例3 CDV、CPV和RV的多重荧光免疫分析方法检测方法的建立
(1)CDV、CPV和RV质粒的构建
用天根的核酸自动抽取仪分别提取CDV、CPV和RV的核酸,分别用引物对CDV1和CDV2、CPV1和CPV2、RV1和RV2进行PCR扩增,将扩增产物分别进行琼脂糖凝胶电泳检测并切胶纯化,将纯化后的cDNA分别连接至pMD-19T载体中,将连接产物转化至DH5a感受态细胞,挑选单克隆,进行菌落PCR鉴定,将鉴定为阳性菌的菌落进行质粒抽提,送测序。
(2)质粒PCR扩增
用实施例1所述的引物分别对CDV、CPV和RV进行单重、三重PCR扩增。
上游引物混合液的制备:将CDV1、CPV1和RV1以摩尔比1:1:1:1比例进行混合;下游引物混合液的制备:将CDV2、CPV2和RV2以摩尔比1:1:1:1比例进行混合。利用CDV、CPV和R三种病原的特异性模板,以及CDV、CPV和RV三重混合模板,对上述三种病原的特异性区域进行扩增。其中三重模板的制备:将三种质粒以以体积比1:1:1:1的比例进行混合。
PCR扩增反应体系如下:
5×One-step RT-PCR buffer5μl
Enzyme 1μl
dNTP 1μl
上游引物混合液 2μl (各引物终浓度为0.2μM)
下游引物混合液 2μl(各引物终浓度为0.2μM)
模板 2 μl (< 500ng)
ddH2O>
Total 25μl。
扩增的反应程序为:50℃逆转录30min;95℃预变性15min;95℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸20s,循环35次;72℃终延伸10min。
电泳检测结果:将上述PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,其电泳图如图1所示。1:DM2000 DNA marker;2:CDV;3:CPV;4:RV;5:NTC(PCR空白对照);6:对CDV+CPV+RV进行的三重PCR。从图1中可以看出,CDV的扩增产物大小约为151bp,CPV的扩增产物大小约为163bp,RV的扩增产物大小约为155bp,由于这三种病原的扩增产物大小相近,所以三重PCR 扩增产物的电泳条带无法分辨。
(3)将所得的PCR产物与荧光编码微球工作液、链霉亲和素藻红蛋白(SAPE)工作液杂交,包括以下步骤:
分别包被有特异的anti-tag序列的3种微球,其中anti-tag序列能相应地与CDV、CPV和RV三种病原引物上的tag序列互补配对。三种微球均购自luminex公司,具体的CDV、CPV和RV分别对应的荧光编码微球号为MTAG-A067、MTAG-022和MTAG-034。
荧光编码微球工作液的制备:将2500个/μl荧光编码微球用1.1×Tm Hybrdization Buffer稀释到1μl约含有125个/种荧光编码微球。
SAPE工作液制备:将1mg/ml SAPE用1×Tm Hybrdization Buffer稀释到10μg/μl。
充分重悬荧光编码微球工作液,每个样品孔和背景孔加入微球工作液20μl,样品孔中加入5μl PCR产物,背景孔中加入5μl NTC产物,再加入75μl的SAPE工作液,充分混匀,于金属加热器中45℃孵育30min。
依照检测仪Luminex 200仪器的说明将杂交后的100μl上述反应液进行检测,结果如图2所示,虽然三重模板的扩增产物无法用电泳分辨,但用检测仪Luminex 200仪器读取MFI值时,可以明显分辩不同类型的病原。
结果判断标准(注:该判断标准仅供参考,亦可对结果判断标准进行调整)如下:
最低检测阈值(cutoff值)的确定:选取10份健康犬组织样品(每个样品平行重复3次),分别读取MFI值并计算其平均值和标准差。以平均值加3倍标准差的MIF值设定其为cutoff值。本发明所获得cutoff值为182.5,因此将本发明的cutoff值定为200。只有检测样品的MFI值高于200时,该实验数据才能进行有效分析。
待测样本的分析判断:1)当待测样本的MFI值>200时,判断为阳性样本;2)待测样本的MFI值≤200时,判断为阴性,需要进行重复实验或采取其他检测方法进一步验证。
实施例4 CDV、CPV和RV的多重荧光免疫分析检测特异性实验
分别用犬瘟病毒(CDV)、犬细小病毒(CPV)、狂犬病毒(RV)、犬腺病毒(CAV)、犬副流感病毒(CPiV)、犬冠状病毒(CCV)作为模板进行多重荧光免疫分析检测。实验结果如图3所示,只有犬瘟病毒、犬细小病毒、狂犬病毒为阳性,其他均为阴性,说明本检测体系特异性良好。
实施例5:CDV、CPV和RV的多重荧光免疫分析检测灵敏性实验
将制备的质粒进行定量,采用10倍稀释法进行梯度稀释,稀释至101copies/μl,用上述建立的多重荧光免疫分析方法进行检测。CDV、CPV和RV的多重荧光免疫分析检测灵敏性实验结果如图4所示,实验结果表明,CDV、CDV和RV的最低检出量分别为为102copies/μl、102copies/μl和103copies/μl。
实施例6:样品的检测
将所收集的犬的拭子、粪便、尿液、唾液等临床样品,用核酸自动抽取仪抽提核酸作为反应模板,并使用Qiagen的One-Step RT PCR kit进行扩增。采用上述CDV、CPV和RV的多重荧光免疫分析检测方法进行检测,扩增产物与荧光编码微球和SAPE杂交,在Luminex 200检测仪上读取数据。具体步骤参照实施例3,实验结果如图5所示。
经普通PCR检测实验结果表明,样品1、3、5、7、8、10均为阴性;2、4、9为CDV阳性样品;4、6、9为CPV阳性样品。其中,样品4、9为CDV、CPV混合感染样品。通过测序分析,结果一致。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
<110>广东省实验动物监测所
<120>一种快速区分犬瘟病毒、犬细小病毒和狂犬病毒的多重荧光免疫分析方法及
试剂盒
<130>
<160>9
<170>PatentIn version 3.5
<210>1
<211>20
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<400>8
caaacaaaca ttcaaatatc aatc 24
<210>9
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<212>DNA
<213>人工序列
<400>9
tactacttct ataactcact taaa 24
机译: 快速区分兔出血性病毒,仙台病毒和赖氨酸轮状病毒及试剂的多重荧光免疫分析法
机译: 表达至少一种抗原的重组犬疱疹病毒,特别是犬瘟热,狂犬病,犬细小病毒和2型副流感病毒的抗原,以及基于这种病毒的疫苗
机译: 一种用于同时免疫犬瘟,犬瘟热,犬肝炎和钩端螺旋体病的疫苗的制备方法