一种开发黄姑鱼SSR分子标记用于种群鉴定方法

摘要

本发明公开了一种开发黄姑鱼SSR分子标记用于种群鉴定方法，包括以下步骤：使用多个个体的黄姑鱼混合组织提取RNA，进行RNA测序，拼接获得黄姑鱼表达基因序列，利用生物信息学方法获得潜在的SSR标记；利用SSR侧翼序列设计引物，从随机样品中使用鱼鳍提取基因组DNA，筛选SSR引物；用每一对SSR引物对不同黄姑鱼DNA模板进行PCR扩增，对扩增产物使用Qsep100全自动核酸分析系统进行毛细管电泳检测，从中筛选出扩增结果有差异的引物，利用PopGene计算等位基因组成及其频率，对黄姑鱼群体关系和遗传结构进行分析。本发明提供的鉴定黄姑鱼群体验证的SSR分子标记方法稳定可靠，不受年龄，性别和生长季节的影响，为黄姑鱼群体分析，品种鉴定、选育和评价提供了科学依据。