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基于脑磁共振影像中磷酸化tau蛋白含量信息的检测系统

摘要

本发明公开了一种基于脑磁共振影像中磷酸化tau蛋白含量信息的检测系统,设置有MRI图像采集装置、图像预处理装置、特征提取装置以及参数反演装置;所述参数反演装置用于将最优特征子集反演出磷酸化tau蛋白含量;该参数反演装置中固化有训练好的SVM模型,所述SVM模型是通过选择多个训练样本图像的多个特征参数,并以每个样本图像对应PET图像的磷酸化tau蛋白含量为评价标准,最终训练出的最优特征子集与磷酸化tau蛋白含量的映射关系。该系统可仅通过脑磁共振图像就可以定量显示磷酸化tau蛋白含量,具有无创、无辐射、安全、自动化程度高等优点。

著录项

  • 公开/公告号CN104867153A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2015-08-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 重庆大学;

    申请/专利号CN201510280008.2

  • 发明设计人 李勇明;吕洋;王品;刘玉川;徐莎;

    申请日2015-05-28

  • 分类号G06T7/00(20060101);G06K9/62(20060101);

  • 代理机构重庆为信知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人陈千

  • 地址 400044 重庆市沙坪坝区沙坪坝正街174号

  • 入库时间 2023-12-18 10:36:06

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-10-20

    授权

    授权

  • 2015-09-23

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06T7/00 申请日:20150528

    实质审查的生效

  • 2015-08-26

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明涉及到医学图像处理技术,具体地说,是一种基于脑磁共 振影像中磷酸化tau蛋白含量信息的检测系统。

背景技术

磷酸化tau蛋白是诊断阿尔茨海默病的重要指标之一,现有技术 中通常利用PET扫描成像,通过计算PET图像中磷酸化tau蛋白沉积区 域所对应的像素的总数来作为磷酸化tau含量。

但其存在的缺陷是:PET扫描成像成本高,而且需要预先给病 人注射放射性试剂,具有一定的辐射作用,容易给病人带来一定的心 理压力。

发明内容

针对现有技术的不足,本发明的目的是提供一种基于脑磁共振影 像中磷酸化tau蛋白含量信息的检测系统,该系统主要结合图像处理 技术和智能识别算法,利用脑磁共振影像中的图像特征信息来实现磷 酸化tau蛋白含量的检测,避免使用PET扫描所带来的不良影响。

为达到上述目的,本发明所采用的具体技术方案如下:

一种基于脑磁共振影像中磷酸化tau蛋白含量信息的检测系统, 其关键在于:设置有MRI图像采集装置、图像预处理装置、特征提 取装置以及参数反演装置;

所述图像预处理装置中依次设置有滤波去噪装置、图像配准装置、 头骨剥离装置和组织分割装置;

所述滤波去噪装置用于实现MRI图像的去噪处理;

所述图像配准装置用于实现待测图像头部位置的调整;

所述头骨剥离装置用于去除图像中的脑外组织;

所述组织分割装置用于将图像中的脑组织图像分割为脑新皮层、 白质、灰质、丘脑和海马体五个解剖结构;

所述特征提取装置用于提取最优特征子集;

所述参数反演装置用于将所述最优特征子集反演出磷酸化tau蛋 白含量;该参数反演装置中固化有训练好的SVM(support vector  machine,支持向量机)模型,所述SVM模型是通过选择多个训练样 本图像的多个特征参数,并以每个样本图像对应PET图像的磷酸化 tau蛋白含量为评价标准,最终训练出的最优特征子集与磷酸化tau 蛋白含量的映射关系。

作为进一步描述,所述参数反演装置中设置有训练样本图像获取 装置、训练样本图像预处理装置、训练样本图像特征提取装置、训练 样本特征选择装置、测试样本图像获取装置、测试样本图像预处理装 置、测试样本图像特征提取装置以及分类器构建装置;

所述训练样本图像获取装置用于获取训练样本MRI图像和该 MRI图像对应的PET图像,并通过PET图像计算磷酸化tau蛋白含 量作为分类器的评价标准;

所述训练样本图像预处理装置与所述图像预处理装置的结构和 功能相同;

所述训练样本图像特征提取装置用于提取SVM模型所需的多个 特征参数;

所述训练样本特征选择装置用于实现多个特征参数的选择;

所述测试样本图像获取装置用于获取测试样本MRI图像和该 MRI图像对应的PET图像,并通过PET图像计算磷酸化tau蛋白含 量作为分类器的评价标准;

所述测试样本图像预处理装置与所述图像预处理装置的结构和 功能相同;

所述测试样本图像特征提取装置用于提取训练样本特征选择装 置所选择出的特征参数;

所述分类器构建装置用于构建特征参数与磷酸化tau蛋白含量的 反演关系,该分类器的核函数采用径向基函数,当所述测试样本的识 别率达到预设目标时,最终训练出的最优特征子集与磷酸化tau蛋白 含量的映射关系。

再进一步描述,所述训练样本图像特征提取装置所提取的多个特 征参数包括每个解剖结构的体积、灰度分布的不均匀性、灰度平均、 灰度均方差、灰度熵、信息熵、几何矩、对比度、差分矩、自相关、 梯度分布的不均匀性、梯度、梯度平均、梯度均方差、梯度熵、逆差 矩、平均弥散率和各向异性分数值。

作为优选,所述训练样本图像特征提取装置采用离散二进制PSO 算法进行特征选择。

本发明的显著效果是:

本发明通过智能遗传算法对SVM模型进行训练,从而得到最优 特征子集与磷酸化tau蛋白含量的映射关系,将训练好的SVM模型 固化到参数反演装置中,从而构建出本发明所提出的基于脑磁共振影 像中磷酸化tau蛋白含量信息的检测系统,该系统可仅通过脑磁共振 图像中的特征信息就可以定量判定出磷酸化tau蛋白含量,具有无创、 无辐射、安全、自动化程度高等优点。

附图说明

图1是本发明的系统原理框图。

具体实施方式

下面结合附图对本发明的具体实施方式以及工作原理作进一步 详细说明。

如图1所示,一种基于脑磁共振影像中磷酸化tau蛋白含量信息 的检测系统,设置有MRI图像采集装置、图像预处理装置、特征提 取装置以及参数反演装置;

所述图像预处理装置中依次设置有滤波去噪装置、图像配准装置、 头骨剥离装置和组织分割装置;

所述滤波去噪装置用于实现MRI图像的去噪处理;

所述图像配准装置用于实现待测图像头部位置的调整;

具体实施时可以采用基于属性向量的弹性配准(Hierarchical  Attribute Matching Mechanism for Elastic Registration,HAMMER)算 法对图像样本进行弹性配准,采用互信息值和相关系数作为弹性配准 满意的评价准则。

所述头骨剥离装置用于去除图像中的脑外组织;

由于脑MRI图像中脑新皮层、白质、灰质、丘脑、海马体中明 显存在磷酸化tau蛋白,亮度较暗,且体积和纹理有变化,因此组织 分割装置用于将图像中的脑组织图像分割为脑新皮层、白质、灰质、 丘脑和海马体五个解剖结构,具体实施时可以采用ITK程序包 (Insight Segmentation and Registration Toolkit)对以上解剖结构进行 分割。

所述特征提取装置用于提取最优特征子集;

所述参数反演装置用于将所述最优特征子集反演出磷酸化tau蛋 白含量;该参数反演装置中固化有训练好的SVM模型,所述SVM 模型是通过选择多个训练样本图像的多个特征参数,并以每个样本图 像对应PET图像的磷酸化tau蛋白含量为评价标准,最终训练出的最 优特征子集与磷酸化tau蛋白含量的映射关系。

在具体实施过程中,所述参数反演装置中设置有训练样本图像获 取装置、训练样本图像预处理装置、训练样本图像特征提取装置、训 练样本特征选择装置、测试样本图像获取装置、测试样本图像预处理 装置、测试样本图像特征提取装置以及分类器构建装置;

所述训练样本图像获取装置用于获取训练样本MRI图像和该 MRI图像对应的PET图像,并通过PET图像计算磷酸化tau蛋白含 量作为分类器的评价标准;

所述训练样本图像预处理装置与所述图像预处理装置的结构和 功能相同;

所述训练样本图像特征提取装置用于提取SVM模型所需的多个 特征参数;

所述训练样本特征选择装置用于实现多个特征参数的选择;

所述测试样本图像获取装置用于获取测试样本MRI图像和该 MRI图像对应的PET图像,并通过PET图像计算磷酸化tau蛋白含 量作为分类器的评价标准;

所述测试样本图像预处理装置与所述图像预处理装置的结构和 功能相同;

所述测试样本图像特征提取装置用于提取训练样本特征选择装 置所选择出的特征参数;

所述分类器构建装置用于构建特征参数与磷酸化tau蛋白含量的 反演关系,该分类器的核函数采用径向基函数,当所述测试样本的识 别率达到预设目标时,最终训练出的最优特征子集与磷酸化tau蛋白 含量的映射关系。

所述训练样本图像特征提取装置所提取的多个特征参数包括每 个解剖结构的体积、灰度分布的不均匀性、灰度平均、灰度均方差、 灰度熵、信息熵、几何矩、对比度、差分矩、自相关、梯度分布的不 均匀性、梯度、梯度平均、梯度均方差、梯度熵、逆差矩、平均弥散 率和各向异性分数值。

上述特征参数中,第1个特征表明磷酸化tau蛋白对体积的影响; 第2-4个特征表明磷酸化tau蛋白对亮度的影响;第6-16个特征表明 磷酸化tau蛋白对纹理的影响;第17-18个特征为纤维束特性;将 MRI图像纹理特征记为fj(j=1,2,p),形状特征记为fs(i=1,2,m)。

在SVM模型训练过程中,可以通过合并纹理特征ft(j=1,2,p)和 形状特征fs(i=1,2,m),并基于合并后的特征和SVM回归算法,建立 反演模型,反演过程中将对应PET图像的磷酸化tau蛋白含量记为 Count_tau,并以此为评价标准,通过反演准确性来进行特征选择, 最终获得最优特征子集,记为fj(j=1,2,p),反演得到最接近Count_tau 的相应磷酸化tau蛋白含量Count_tau’以及回归模型SVM_final;优 选的fj(j=1,2,p)以及SVM_final,最后以SVM_final作为训练好的 SVM模型,通过提取其它MRI图像中的最优特征子集即可反演出该 MRI图像对应的磷酸化tau蛋白含量。

在实施过程中,采集40例MRI图像样本和对应的PET图像样本 (正常人脑的图像和确诊老年痴呆人脑的图像各一半),选择一幅图 像作为参考图像,将其余图像向其配准;然后通过头骨剥离,去除图 像中的非脑组织;接着进行组织分割,从脑组织中分离出脑新皮层、 白质、灰质、丘脑、海马体等几部分;最后从每个组织中提取出体积、 灰度分布的不均匀性、灰度平均、灰度均方差、灰度熵、信息熵、几 何矩、对比度、差分矩、自相关、梯度分布的不均匀性、梯度、梯度 平均、梯度均方差、梯度熵、逆差矩、平均弥散率和各向异性分数值 等18个特征,即每幅图包含5*18=90个特征。

将MRI图像样本和对应的PET图像样本随机分为A,B两组,每组 包含20例MR图像和对应的20例PET图像(正常人脑的图像和确诊老 年痴呆人脑的图像各一半),A组用于参数反演模型训练,B组用于对 模型进行性能测试。

基于SVM的参数反演模型,采用A部分作为训练样本,B部分作 为测试样本。通过反演准确性来进行特征筛选,最终获得最优特征子 集fj(j=1,2,p),以及反演得到最接近Count_tau的相应磷酸化tau蛋白 含量Count_tau’,特征选择采用离散二进制PSO算法。

SVM分类器的核函数为径向基函数,采用5阶校验法,训练收 敛准则为均方误差(Mean squared normalized error,MSE),利用A 部分样本数据进行测试,对SVM进行参数回归,输入向量为图像特 征值,输出为磷酸化tau蛋白含量标准值,均方误差满足要求时训练 停止,获取参数矩阵,即最优特征子集与磷酸化tau蛋白含量的映射 关系。

在训练过程中,由于待选特征较多,特征与磷酸化tau蛋白含量 的关系未明且复杂,因此,需要设计精度高的搜索算法加以解决。采 用离散二进制PSO算法,结合小样本学习能力强的SVM分类器实现 了混合式特征选择,精度大大提高。此外,通过对SVM分类器参数 优化,实现了较好的参数反演能力。

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