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一种LncRNA与mRNA关联分析的方法

摘要

本发明根据基因序列表达和基因预测算法,找到了一种将LncRNA与mRNA相关联的生物信息学方法,可深度挖掘基因表达的生物学意义,以便于进一步的实验验证。在创新性方面,我们的方法解决了常规方法单一研究一种检测数据的问题。通过两种检测手段结果的关联分析,深度挖掘了所蕴含的生物学意义。其基本流程如下:步骤一:对LncRNA芯片检测所获得的数据进行数据预处理及均一化;步骤二:筛选差异表达的LncRNA;步骤三:筛选差异表达的mRNA;步骤三:针对差异表达的lncRNA预测其cis作用方式的靶基因;步骤四:针对差异表达的lncRNA预测其trans作用方式的靶基因;步骤五:整理长链非编码RNA的信息和靶基因(差异表达的mRNA)之间的关系进行网络构建。

著录项

  • 公开/公告号CN102799796A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2012-11-28

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海聚类生物科技有限公司;

    申请/专利号CN201110135546.4

  • 发明设计人 曾华宗;

    申请日2011-05-24

  • 分类号G06F19/20(20110101);C12Q1/68(20060101);

  • 代理机构

  • 代理人

  • 地址 200333 上海市祁连山南路999弄80号801室

  • 入库时间 2023-12-18 07:26:32

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2015-01-07

    发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):G06F19/20 申请公布日:20121128 申请日:20110524

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2012-11-28

    公开

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