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6-磷酸葡萄糖脱氢酶和(S)-羰基还原酶偶联提高(S)-苯基乙二醇转化效率的方法

摘要

6-磷酸葡萄糖脱氢酶和(S)-羰基还原酶偶联提高(S)-苯基乙二醇转化效率的方法,属于生物催化不对称转化技术领域。本发明提供了一株重组毕赤酵母CGMCCNo.4198,及其多批次催化2-羟基苯乙酮,制备(S)-苯基乙二醇的方法。本发明将酿酒酵母6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因与近平滑假丝酵母(S)-羰基还原酶基因同时整合至毕赤酵母基因组中,在5%(w/v)葡萄糖的参与下,全细胞重复利用10个批次,不对称转化制备(S)-苯基乙二醇的光学纯度和产率始终维持在100%和85%以上。该重组菌株利用多基因共表达提高全细胞转化(S)-苯基乙二醇的批次稳定性,不仅很好地解除了生物转化反应中辅酶再生循环的制约;同时也为工业上多批次、低成本制备(S)-苯基乙二醇提供了一种高效途径。

著录项

  • 公开/公告号CN101993828A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2011-03-30

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 江南大学;

    申请/专利号CN201010534231.2

  • 发明设计人 张荣珍;徐岩;张波涛;耿亚维;

    申请日2010-11-08

  • 分类号C12N1/19(20060101);C12N15/53(20060101);C12N15/81(20060101);C12P41/00(20060101);C12P7/22(20060101);C12R1/84(20060101);

  • 代理机构32104 无锡市大为专利商标事务所;

  • 代理人时旭丹;刘品超

  • 地址 214122 江苏省无锡市滨湖区蠡湖大道1800号江南大学生物工程学院

  • 入库时间 2023-12-18 02:00:44

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2012-01-04

    授权

    授权

  • 2011-05-18

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N1/19 申请日:20101108

    实质审查的生效

  • 2011-03-30

    公开

    公开

说明书

技术领域

6-磷酸葡萄糖脱氢酶和(S)-羰基还原酶偶联提高(S)-苯基乙二醇转化效率的方法,利用基因共表达提高全细胞不对称转化(S)-苯基乙二醇的效率和批次稳定性的方法,本发明涉及利用基因工程的手段,构建了(S)-羰基还原酶(SCRⅡ)和6-磷酸葡萄糖脱氢酶(G6PDH)共表达的重组毕赤酵母菌(Pichia pastoris)SCRⅡG,高效制备(S)-苯基乙二醇,属于生物催化不对称转化技术领域。

背景技术

光学纯的苯基乙二醇(PED)是液晶材料中不可缺少的手性添加剂,也是制备具有光学活性的医药、农药和功能材料的重要中间体。生物法转化制备光学纯(S)-苯基乙二醇,通常以微生物全细胞或酶为催化剂,采用不同的化学反应途径,如Bakers’酵母不对称还原2-羟基苯乙酮法,环氧化物水解酶催化水解外消旋苯乙烯氧化物法,和萘双氧化酶(NDO)选择性氧化苯乙烯法等,这些方法存在底物浓度低,需要昂贵的辅酶,产物光学纯度低等缺点。氧化还原酶催化的不对称还原反应中,辅酶不能循环使用是限制其工业化应用的“瓶颈”因素。

全细胞体系辅酶再生主要有两种策略:一是在反应体系中添加醇或糖类辅助底物,构成底物耦联再生系统;二是通过基因工程手段在细胞中构建酶耦联再生系统。如Degussa公司利用该辅酶再生的原理催化三甲基丙酮酸不对称还原合成L-叔亮氨酸,大大提高了产物的转化率。ω-转氨酶、醇脱氢酶和葡萄糖脱氢酶组成的耦联体系用于高效转化(R)-苯乙醇。

本实验室已经利用重组菌株催化不对称还原反应,制备(S)-苯基乙二醇,在此基础上,利用基因工程技术,将酿酒酵母6-磷酸葡萄糖脱氢酶(G6PDH)基因ZWF1与近平滑假丝酵母(S)-羰基还原酶基因scrⅡ整合至毕赤酵母基因组中,构建了共表达偶联体系Pichia pastoris/SCRⅡG,在5% (w/v) 葡萄糖的参与下,Pichiapastoris/SCRⅡG不对称还原2-羟基苯乙酮的催化效率大大提高,反应十个批次后,产物(S)-苯基乙二醇光学纯度和产率分别高达100%和85%以上。

发明内容

(1)要解决的技术问题

本发明的目的是提供一种基因工程方法构建多酶偶联体系,实现了多种酶功能的成功整合。利用酶偶联后的重组菌株Pichiapastoris/SCRⅡG (菌种保藏号:CGMCC No.4198)高效不对称转化制备(S)-苯基乙二醇的方法。本发明根据酿酒酵母6-磷酸葡萄糖脱氢酶和近平滑假丝酵母(S)-羰基还原酶的功能,利用基因工程技术,构建双酶偶联毕赤氏酵母体系,以酶偶联重组菌为催化剂,实现了从2-羟基苯乙酮到(S)-苯基乙二醇的高效转化。在5% (w/v) 葡萄糖的参与下,当底物浓度为6 mg/mL 时,经过十批次的催化反应,产物(S)-苯基乙二醇光学纯度高达100%,产率维持在85%以上。本发明为解除辅酶再生循环的限制,成功整合双酶功能,提高手性醇制备效率提供了一条崭新的思路。

(2)技术方案

一株不对称制备(S)-苯基乙二醇的重组菌,其分类命名为巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)SCRⅡG ,已保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,保藏编号:CGMCC No.4198。

利用重组菌CGMCC No.4198不对称转化制备 (S)-苯基乙二醇的方法,不对称转化反应条件:在0.1 mol/L pH 5.5的醋酸缓冲液中,加质量/体积比5%葡萄糖,底物2-羟基苯乙酮的浓度为6 mg/mL,重组菌细胞浓度为0.1 g/mL,不加辅助底物,反应温度为35℃,反应时间为24 h,转速150 r/min,重组菌菌体重复利用十个批次。

反应结束后,将反应混合物离心除去菌体,上清液加入2倍体积乙酸乙酯萃取,有机相用于分析。产物通过手性固定相高效液相色谱(Agillent HP1100) 进

行分析,条件为Chiralcel OB-H柱(4.6 mm ×25 cm; Daicel Chemical Ind., Ltd., Japan),流动相为正己烷/异丙醇(9/1,V/V),流速0.5 mL/min,检测波长为215 nm。产物的光学纯度通过对映过量值来衡量。

产物(S)-苯基乙二醇对映过量值的计算:对映过量值( e.e.%)=[(CS-CR)/(CR+CS)]*100% 

产物(S)-苯基乙二醇产率的计算:产率(%)= CS/C0*100%

式中CR为反应后(R)-对映体的浓度,CS为反应后(S)-对映体的浓度,C0为反应前底物(R)-苯基乙二醇的浓度。

以全细胞为催化剂,不对称生物转化反应后,产物均为(S)-苯基乙二醇。

重组菌的培养:

BMGY(Buffered Glycerol-complex Medium)培养基,以质量/体积%计:酵母膏1%,蛋白胨2%,甘油1%,pH 6.0、100 mmol/L磷酸缓冲液10%,YNB1.34%,生物素4×10-5%,用去离子水补足至100%;

BMMY(Buffered Methanol-complex Medium)培养基,以质量/体积%计:酵母膏1%,蛋白胨2%,甲醇0.5%,pH 6.0、100 mmol/L磷酸缓冲液10%,YNB1.34%,4×10-5% 生物素,用去离子水补足至100%;

培养条件:将重组菌CGMCC No.4198按1%的接种量接种于装有25 mL BMGY培养基的100 mL摇瓶中,在28℃、250 r/min的条件下,培养至菌浓OD600=2-6;室温3000 g离心5 min,收集菌体,用100 mL BMMY重悬菌体,使OD600为1.0,置于500 mL的摇瓶中,在28℃、250 r/min的条件下培养,每12 h,按培养基质量/体积%计添加甲醇0.5%至培养基中,培养96h,10,000 rpm离心10 min,沉淀用生理盐水洗涤两次,收集得到重组菌全细胞。

所述重组菌 CGMCC No.4198的构建方法,将scrⅡ基因插入pPIC3.5K中构建重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ,电击转化毕赤氏酵母GS115感受态细胞,获得重组菌Pichia pastoris/ pPIC3.5K-SCRⅡ;同时将基因ZWF1插入载体pPICZα,获得重组质粒pPICZα-ZWF1,用SacI对 pPICZα-ZWF1进行单酶切线性化,电转化感受态重组毕赤酵母Pichia pastoris/ pPIC3.5K-SCRⅡ的感受态细胞,涂布含有100 μg/mL Zeocin(博来霉素)的YPD平板,挑取阳性单克隆得到重组菌Pichia pastoris/SCRⅡG。质粒pPIC3.5K和质粒pPICZα均购自Invitrogen公司。

重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ的构建:利用限制性内切酶BamH I和Not I分别对载体pPIC3.5K和基因片段scrⅡ进行酶切,纯化后的基因片段与载体通过粘性末端进行连接,获得重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ。

重组质粒pPICZα-ZWF1的构建,利用限制性内切酶BstB I 和Xho I分别对载体pPICZα和基因片段ZWF1进行酶切,纯化后的基因片段与载体通过粘性末端进行连接,获得重组质粒pPICZα-ZWF1。

基因片段scrⅡ的获取:实验室已知scrⅡ基因全序列,以近平滑假丝酵母的基因组为模板,设计含有BamH I酶切位点的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和含有NotI酶切位点的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_R,通过PCR,获得scrⅡ基因全长,全长为837 bp。

SCRⅡ_pPIC3.5K_F: CGGGATCCACCATGGGCCATCATCATCATCATCATAGC AGTGGCATGGGCGAAATCGAATC (BamH I)

SCRⅡ_pPIC3.5K_R: TTGCGGCCGCCTATGGACAAGTGTAACCACCATCGAC (Not I)

PCR反应体系:10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和SCRⅡ_pPIC3.5K_R 各1 μL,近平滑假丝酵母DNA 

5 μL,5 U/μL 的Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL;PCR反应条件:95℃预变性4 min;94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 1 min,进行30个循环;72℃延伸10 min;获得scrⅡ基因。

基因片段ZWF1的获取:通过NCBI检索得到ZWF1基因全长,以酿酒酵母基因组为模板,利用含BstB I酶切位点的引物pPIC_G6PDH_F和含XhoI 酶切位点的引物pPIC_G6PDH_R,通过PCR,获得ZWF1基因的全长为1518 bp;

pPIC_G6PDH_F: ACTGTTCGAAACGATGAGTGAAGGCCCCGTCAAATTTG AAAAAAATACCG (BstB I)

pPIC_G6PDH_R: CACGCTCGAGCTAATTATCCTTCGTATCTTCTGGC (XhoI)

PCR反应体系: 10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的 dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物pPIC_G6PDH_F和 pPIC_G6PDH_R各1 μL,酿酒酵母基因组5 μL,

5 U/μL的 Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL;PCR反应条件:94℃ 预变性5 min;94℃ 1 min,55℃ l min,72℃ 1 min,进行30个循环,72℃延伸10 min;获得ZWF1基因。

具体操作如下:

一、近平滑假丝酵母(C. parapsilosis)CCTCC M203011(中国专利03132140.2,已公开)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)培养

近平滑假丝酵母的培养基组成以g/L计:葡萄糖40,酵母膏5,(NH4)2HPO13,KH2PO4 7,ZnSO4·7H2O 0.3,NaCl 0.1,pH 7.0;将近平滑假丝酵母菌种CCTCC M203011接种于培养基装液量为20%的250 mL摇瓶中于30℃、150 rpm振荡培养48h;

酿酒酵母的培养基组成以g/L计:胰蛋白胨10,酵母提取物5,NaCl 10,葡萄糖10,pH 7.0;将酿酒酵母菌种接种于培养基装液量为20%的250 mL摇瓶中于30℃、150 rpm振荡培养48h;

二、近平滑假丝酵母(C. parapsilosis)CCTCC NO:M 203011基因组和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)基因组的获取

近平滑假丝酵母CCTCC M203011和酿酒酵母培养结束后,分别将菌体于6,000 g离心20 min,用生理盐水洗涤两次后收集细胞,利用VIOGENE公司的基因组DNA提取试剂盒Genomic DNA Extraction Miniprep System提取近平滑假丝酵母基因组和酿酒酵母的基因组。

三、scrⅡ基因的获得

以近平滑假丝酵母(C. parapsilosis)CCTCC M203011基因组作为PCR反应模板,利用含有BamH I酶切位点的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和含有NotI酶切位点的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_R,通过PCR扩增获得scrⅡ基因,全长为837 bp。

SCRⅡ_pPIC3.5K_F: CGGGATCCACCATGGGCCATCATCATCATCATCAT AGCAGTGGCATGGGCGAAATCGAATC (BamH I)

SCRⅡ_pPIC3.5K_R: TTGCGGCCGCCTATGGACAAGTGTAACCACCAT CGAC (Not I)

PCR反应体系:10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和SCRⅡ_pPIC3.5K_R 各1 μL,近平滑假丝酵母DNA 5 μL,5 U/μL 的Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL。PCR反应条件:95℃预变性4 min;94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 1 min,进行30个循环;72℃延伸10 min,获得scrⅡ基因;利用3S Spin Agarose Gel DNA Purification Kit(上海申能博彩生物科技有限公司)纯化scrⅡ基因。

四、ZWF1基因的获得

以酿酒酵母基因组为模板,利用含BstB I酶切位点的引物pPIC_G6PDH_F和含XhoI 酶切位点的引物pPIC_G6PDH_R,通过PCR获得ZWF1基因,全长为1518 bp。

pPIC_G6PDH_F: ACTGTTCGAAACGATGAGTGAAGGCCCCGTCAAAT TTGAAAAAAATACCG (BstB I)

pPIC_G6PDH_R: CACGCTCGAGCTAATTATCCTTCGTATCTTCTGGC (XhoI)

PCR反应体系: 10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的 dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物pPIC_G6PDH_F和 pPIC_G6PDH_R各1 μL,酿酒酵母基因组5 μL,5 U/μL的 Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL;PCR反应条件:94℃ 预变性5 min;94℃ 1 min,55℃ l min,72℃ 1 min,进行30个循环,72℃延伸10 min;获得ZWF1基因。利用3S Spin Agarose Gel DNA Purification Kit(上海申能博彩生物科技有限公司)纯化ZWF1基因。

五、重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ的构建

BamH I和Not I分别对载体pPIC3.5K和基因片段scrⅡ进行酶切,纯化后的基因片段scrⅡ与载体pPIC3.5K通过粘性末端连接,获得带有目标基因片段scrⅡ的重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ。

六、重组质粒pPICZα-ZWF1的构建

利用限制性内切酶XhoI和BstB I分别对载体pPICZα和基因片段ZWF1进行酶切,纯化后的基因片段ZWF1与载体pPICZα通过粘性末端连接,获得带有目标基因片段ZWF1的重组质粒pPICZα-ZWF1。

七、重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ转化毕赤氏酵母

取20 μL重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ,用限制性内切酶SacI单酶切线性化后,电击转化感受态毕赤酵母GS115,30℃静置1 h,涂布于MD平板上,挑取克隆经PCR验证,获得重组菌Pichiapastoris/pPIC3.5K-SCRⅡ。

PCR验证反应体系:10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和SCRⅡ_pPIC3.5K_R 各1 μL,毕赤氏酵母DNA 5 μL,5 U/μL 的Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL。PCR验证反应条件:95℃预变性4 min;94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 1 min,进行30个循环;72℃延伸10 min。

八、重组质粒pPICZα-ZWF1转化重组菌Pichiapastoris/pPIC3.5K-SCRⅡ

Pichia pastoris/pPIC3.5K-SCRⅡ涂布MD平板,两天后挑取单克隆,制备感受态,采用SacI单酶切后的质粒pPICZα-ZWF1,电转化Pichiapastoris/pPIC3.5K-SCRⅡ感受态细胞,通过 100 μg/mL Zeocin的YPD平板筛选,获得重组菌Pichia pastoris/SCRⅡG,即CGMCC No.4198。

九、重组菌 CGMCC No.4198的培养

BMGY(Buffered Glycerol-complex Medium)培养基:1% 酵母膏,2% 蛋白胨,1% 甘油,10% 100 mmol/L 磷酸缓冲液pH 6.0,1.34% YNB,4×10-5% 生物素;

BMMY(Buffered Methanol-complex Medium):1% 酵母膏,2% 蛋白胨,0.5% 甲醇,10% 100 mmol/L 磷酸缓冲液pH 6.0,1.34% YNB,4×10-5% 生物素,以去离子水补足至100%。

培养条件:将重组菌 CGMCC No.4198按1%接种量接种于装有25 mL BMGY培养基的100 mL摇瓶中,在28℃、250 r/min的条件下,培养至菌浓OD600为2-6;以3,000 g离心5 min,收集菌体,用100 mL BMMY重悬菌体,使菌体OD600达1.0左右,转至500 mL的摇瓶中,在28℃、250 r/min的条件下进行培养;每隔12 h,添加0.5%甲醇于培养基中,菌体连续培养96h后,于10,000 rpm离心10 min,收集菌体,并用生理盐水洗涤两次,重新收集菌体细胞。

    (3)有益效果

通过将(S)-羰基还原酶SCRⅡ(编码基因的GenBank登记号FJ939563)和6-磷酸葡萄糖脱氢酶G6PDH (编码基因的GenBank登记号 BK006947.2)进行偶联,共表达于毕赤酵母细胞中。利用成功构建的重组菌CGMCC No.4198(Ppastoris/SCRⅡG)不对称催化2-羟基苯乙酮,转化(S)-苯基乙二醇。通过反应条件优化,在pH5.5的0.1 mol/L醋酸缓冲液中,利用0.1 g/mL重组菌CGMCC No.4198催化6 mg/mL底物2-羟基苯乙酮,35℃下反应24h,连续反应十个批次,最终产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为86.2%。这些工作为从2-羟基苯乙酮到(S)-苯基乙二醇的转化提供了有效途径,为辅酶再生循环途径耦合入(S)-苯基乙二醇的生物转化途径提供了新的研究思路,而且通过菌体多批次循环使用,大大降低了(S)-苯基乙二醇制备成本,为手性醇工业化生产奠定了坚实的基础。

生物材料样品保藏

巴斯德毕赤氏酵母(Pichia pastoris)SCRⅡG,已保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,简称CGMCC,保藏单位地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所,保藏编号:CGMCC No.4198。保藏日期:2010年9月26日。

具体实施方式

实施例1  

近平滑假丝酵母和酿酒酵母的培养。

近平滑假丝酵母培养基组成:葡萄糖4%,酵母膏0.5%,(NH4)2HPO1.3%,KH2PO0.7%,ZnSO4·7H2O 0.03%,NaCl 0.01%,pH7.0。将菌种CCTCC NO:M 203011接种于50 mL培养基的250mL摇瓶中,30℃、150 rpm振荡培养48 h。 

酿酒酵母培养基组成:胰蛋白胨1%,酵母提取物0.5%,NaCl 1%,葡萄糖1%,pH 7.0;将酿酒酵母菌种接种于培养基装液量为20%的250 mL摇瓶中于30℃、150 rpm振荡培养48h。

实施例2  

近平滑假丝酵母和酿酒酵母的基因组的获得:近平滑假丝酵母和酿酒酵母培养结束后,分别将菌体于6,000 g离心20 min,用生理盐水洗涤两次后收集细胞,利用VIOGENE公司的基因组DNA提取试剂盒Genomic DNA Extraction Miniprep System提取近平滑假丝酵母基因组及酿酒酵母的基因组。

实施例3  

scrⅡ基因的获得。以近平滑假丝酵母基因组为模板,利用含有BamH I酶切位点的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和含有NotI酶切位点的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_R,通过PCR,获得SCRⅡ基因全长。

SCRⅡ_pPIC3.5K_F: CGGGATCCACCATGGGCCATCATCATCATCATCA TAGCAGTGGCATGGGCGAAATCGAATC (BamH I)

SCRⅡ_pPIC3.5K_R: TTGCGGCCGCCTATGGACAAGTGTAACCACCATC GAC (Not I)

PCR反应体系:10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和SCRⅡ_pPIC3.5K_R 各1 μL,近平滑假丝酵母DNA 5 μL,5 U/μL 的Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL。PCR反应条件:95℃预变性4 min;94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 1 min,进行30个循环;72℃延伸10 min。获得scrⅡ基因片段。 

实施例4  

ZWF1基因的获得。以酿酒酵母的基因组为模板,利用含利用含BstB I酶切位点的引物pPIC_G6PDH_F和含XhoI 酶切位点的引物pPIC_G6PDH_R,PCR获得ZWF1基因。

pPIC_G6PDH_F: ACTGTTCGAAACGATGAGTGAAGGCCCCGTCAAAT TTGAAAAAAATACCG (BstB I)

pPIC_G6PDH_R:CACGCTCGAGCTAATTATCCTTCGTATCTTCTGGC (XhoI) 

PCR反应体系: 10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的 dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物pPIC_G6PDH_F和 pPIC_G6PDH_R各1 μL,酿酒酵母基因组5 μL,

5 U/μL的 Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL;PCR反应条件:94℃ 预变性5 min;94℃ 1 min,55℃ l min,72℃ 1 min,进行30个循环,72℃延伸10 min;获得ZWF1基因。

实施例5  

重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ的获得。利用限制性内切酶BamH I和NotI分别对载体pPIC3.5K和基因片段SCRⅡ进行酶切,纯化后的基因片段与载体通过粘性末端进行连接,获得重组质粒pPIC3.5K-SCRⅡ。采用SacI对其进行单酶切线性化,电转化感受态毕赤酵母GS115, 30℃静置1 h,涂布于MD平板上,挑取单克隆,经PCR验证后获得重组菌Ppastoris/pPIC3.5K-SCRⅡ。

基因scrⅡ及质粒pPIC3.5K的酶切

利用质粒提取试剂盒Mini-Plasmid Rapid Isolation Kit(北京博大泰克生物基因技术有限公司)提取质粒pPIC3.5K。

分别按照水、缓冲液、基因scrⅡ和酶的顺序,及水、缓冲液、质粒pPIC3.5K和酶的顺序分别加到不同的Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机离心2 s使液体集中于管底,37℃水浴3 h,在管中加入1/10的Loading Buffer或将管置于65℃保温10 min,终止酶切反应。酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,回收和浓缩目的片段。

反应体系组成:10×Buffer H 4 μL,基因scrⅡ或质粒pPIC3.5K 10 μL,BamHI 2 μL,NotI 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL。

基因scrⅡ及质粒pPIC3.5K的连接

连接反应体系组成:质粒pPIC3.5K 0.8 μL,基因scrⅡ 4.2 μL,Ligation Solution 5 μL。混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接12-16 h。

实施例6   

重组质粒pPICZα-ZWF1的获得。利用限制性内切酶XhoI 和BstB I分别对载体pPICZα和ZWF1基因进行酶切,纯化后的基因片段与载体通过粘性末端进行连接,获得重组质粒pPICZα-ZWF1。

基因ZWF1及质粒pPICZα的酶切

利用质粒提取试剂盒Mini-Plasmid Rapid Isolation Kit(北京博大泰克生物基因技术有限公司)提取质粒pPICZα。

分别按照水、缓冲液、基因ZWF1和酶的顺序,及水、缓冲液、质粒pPICZα和酶的顺序加到Eppendorf管中,盖好管盖,振荡使液体充分混匀,置于离心机离心2 s使液体集中于管底,37℃水浴3 h,在管中加入的Loading Buffer或将管置于65℃保温10 min,终止酶切反应。酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,回收和浓缩目的片段。

反应体系组成:10×Buffer H 4 μL,基因ZWF1或质粒pPICZα 10 μL,XhoI 2 μL,BstB I 2 μL,ddH2O将体系补足40 μL。

基因ZWF1与质粒pPICZα的连接

连接反应体系组成:质粒pPICZα 0.8 μL,基因ZWF1 4.2 μL,Ligation Solution 5 μL。混合连接液,将其置于16℃培养箱中连接12-16 h。

实施例7  

重组菌Ppastoris/ pPIC3.5K- SCRⅡ的获得。

毕赤酵母感受态细胞的制备:将毕赤酵母单克隆接种于5 mL YPD液体培养基,30℃,200 r/min,培养过夜;取50 ??L过夜培养物至100 mL YPD液体培养基中,30℃,200 r/min,培养至OD600为2-6;于4℃,5000 r/min离心5 min收集菌液,用100 mL冰预冷的无菌水洗涤两次,收集菌体;分别用10 mL和1 mL冰预冷的1 mol/L的山梨醇溶液洗涤菌体,并收集菌体,每80 ??L分装保存。

重组质粒电击转化毕赤氏酵母感受态细胞:

(1)质粒线性化:提取pPIC3.5k- SCRⅡ质粒,酶切体系为10×buffer 5 μL,质粒(约20 ??g)43 μL,SacI 2 μL,37℃ 4 h,1%琼脂糖凝胶电泳酶切产物,检测酶切是否完全,胶回收酶切产物;

(2)取10 ??L(约5 ??g~10 ??g)的线性化质粒与80 μL的感受态GS115菌体混匀,转至0.2 cm冰预冷的电击杯中;

(3)冰上放置5 min,电压1500 V,电容25 ??F,电阻200 Ω,电击时间为5 ms,进行电击;

(4)电击完毕后,立即加入1 mL冰预冷的1 mol/L的山梨醇溶液,混匀;

(5)30℃静置1 h,涂布于MD平板上,30℃培养2 d。

重组巴斯德毕赤酵母的鉴定:

以提取的近平滑假丝酵母基因组DNA为模板,用引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和SCRⅡ_pPIC3.5K_R进行PCR,PCR反应体系:10×Taq buffer 5 μL,25 mmol/L的dNTP 4 μL,50 pmol/μL的引物SCRⅡ_pPIC3.5K_F和SCRⅡ_pPIC3.5K_R 各1 μL,毕赤氏酵母DNA 5 μL,5 U/μL 的Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 33.5 μL,反应总体积 50 μL。PCR反应条件:95℃预变性4 min;94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 1 min,进行30个循环;72℃延伸10 min。1%琼脂糖凝胶电泳酶切产物检测PCR结果。并保藏阳性克隆Ppastoris/ pPIC3.5K- SCRⅡ。

实施例8  

重组菌Ppastoris/SCRⅡG的获得。将Ppastoris/pPIC3.5K-SCRⅡ涂布MD平板,两天后挑取单克隆,制备感受态,采用Sal I单酶切后的质粒pPICZα-ZWF1,电转化Ppastoris/ pPIC3.5K- SCRⅡ感受态毕赤酵母,涂布含有100 μg/ml Zeocin的YPD平板,挑取阳性单克隆得到重组菌Ppastoris/SCRⅡG。

实施例9  

重组毕赤氏酵母的诱导表达。将重组菌Ppastoris/SCRⅡG按1%的接种量接种于装有25 mL BMGY培养基的100 mL摇瓶中,在28℃、250 r/min的条件下,培养至菌浓OD600为2-6;室温3000 g离心5 min,收集菌体,用100 mL BMMY重悬菌体,使OD600为1.0左右,置于500 mL的摇瓶中,在28℃、250 r/min的条件下培养;每12 h,添加培养体系体积0.5%的甲醇至培养基中,共培养96h,10,000 rpm离心10 min,用生理盐水洗涤两次,收集重组菌细胞。

实施例10  

用实施例9中收集的菌体细胞进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 mg/mL底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1 g/mL重组毕赤酵母P. pastoris/SCRⅡG菌体,混匀后于35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为97.2%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次用于第二批次的转化。

实施例11  

用实施例10中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 mg/mL底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1g/mL实施例10中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心,取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为93.4%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次再用于第三批次的转化

实施例12 

用实施例11中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6mg/mL底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1g/mL实施例11中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,离心取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为91.7%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次,用于第四批次的转化。

实施例13  

用实施例12中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 g/L底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1g/mL实施例12中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心,取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为90.2%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次用于第五批次的转化。

实施例14

用实施例13中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 g/L底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1 g/mL实施例13中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心,取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为89.2%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次用于第六批次的转化。

实施例15

用实施例14中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 g/L底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1 g/mL实施例14中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心,取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为88.9%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次用于第七批次的转化。

实施例16  

用实施例15中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 g/L底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1 g/mL实施例15中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心,取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为88.0%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次用于第八批次的转化。

实施例17 

用实施例16中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 g/L底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1 g/mL实施例16中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心,取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为87.6%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次用于第九批次的转化。

实施例18  

用实施例17中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 g/L底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1g/mL实施例17中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心,取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为87.2%。离心收集的菌体,用生理盐水洗两次用于第十批次的转化。

实施例19  

用实施例18中生理盐水洗涤后的菌体进行生物转化试验。在1 mL 0.1 mol/L醋酸缓冲液(pH5.5),分别加入6 g/L底物2-羟基苯乙酮,5% (w/v) 葡萄糖和0.1g/mL实施例18中收集的菌体细胞,混匀后在35℃恒温摇床上振荡反应24 h,混合物离心取上清液萃取,产物(S)-苯基乙二醇的光学纯度为100%e.e.,产率为86.2%。

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