法律状态公告日
法律状态信息
法律状态
2020-04-03
未缴年费专利权终止 IPC(主分类):C07K1/30 授权公告日:20120530 终止日期:20190415 申请日:20100415
专利权的终止
2014-09-03
专利权的转移 IPC(主分类):C07K1/30 变更前: 变更后: 登记生效日:20140814 申请日:20100415
专利申请权、专利权的转移
2012-05-30
授权
授权
2010-10-20
实质审查的生效 IPC(主分类):C07K1/30 申请日:20100415
实质审查的生效
2010-09-01
公开
公开
技术领域
本发明涉及一种用于蛋白质结晶筛选的96条件试剂盒,特别是以不同分子量的聚乙二醇(PEG)作为沉淀剂用于蛋白质结晶筛选的96条件试剂盒。
背景技术
Hampton Research公司公开的名为IndexTM的96条件筛选试剂盒的具体组成如下表,包括三部分,沉淀剂、盐、缓冲液。沉淀剂主要包括铵盐、钠盐、镁盐、磷酸盐、甲酸盐、有机物、聚合物等,其浓度都较高,在2M左右;盐主要包括钠盐、镁盐、钙盐、硫酸盐、醋酸盐、酒石酸盐等,其浓度较低,在1M以下;缓冲液包括6种,浓度是0.1M,pH值范围从3到9。
表1:IndexTM96条件成分表
文献1“Cycling Temperature Strategy:A Method to Improve the Efficiency ofCrystallization Condition Screening of Proteins,Crystal Growth&Design,2008,8(12):4227-4232”公开了采用上述IndexTM的96条件筛选试剂盒对溶菌酶、刀豆球蛋白、蛋白酶K、过氧化氢酶、α-糜蛋白酶原、竹与蛋白等几种蛋白进行了结晶条件筛选研究,统计出其成功率分别为:29.2%、4.2%、58.3%、15.6%、26.0%、3.1%。
但是IndexTM的局限在于所用沉淀剂都是随机选取,无针对性,对蛋白质结晶的成功率还有待提高;而且所用试剂种类较多,成本较高。
发明内容
为了克服现有的96条件筛选试剂盒在蛋白质结晶条件筛选中成功率低的不足,本发明提供一种以聚乙二醇作为沉淀剂用于蛋白质结晶筛选96条件试剂盒,可以提高蛋白质结晶条件筛选成功率。
本发明解决其技术问题所采用的技术方案为:一种以聚乙二醇为基础的96条件生物大分子结晶筛选试剂盒,其特点是成分组成如下表:
所述沉淀是PEG4000、PEG6000、PEG8000、PEG3350、PEG400、PEG1000、PEG2000或PEG1500任一种。浓度为10%~30%v/v。
所述添加剂是硫酸铵、甲酸钠、氯化镁、丙二酸钠、2-甲基-2,4戊二醇、乙二醇、异丙醇、Tacsimate PH 7.0、甘氨酸、酒石酸钾钠或乙二胺四乙酸任一种。其浓度为0.1M。
所述缓冲液是乙酸钠、柠檬酸钠、2,2-双二羟甲基苯胺或N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磺酸。浓度为0.1M。pH值范围从4到8。
本发明的有益效果是:①本试剂盒所选沉淀剂是BMCD数据库中统计出的使用频率最高的前8种PEG,不是随机选取,所以会显著提高生物大分子结晶的成功率,比如刀豆球蛋白的成功率从4.2%提高到81.2%,溶菌酶的成功率从29.2%提高到46.9%,蛋白酶K的成功率从58.3%提高到66.7%,过氧化氢酶的成功率从15.6%提高到30.2%。②本试剂盒只用了8种PEG,11种添加剂,4种缓冲液,所用试剂种类较少,而且浓度相对较低,所以相对背景技术试剂盒成本较低,有商业推广价值。
具体实施方式
配制PEG Grid Screen96筛选条件:以Al(0.1M的PH4.6的三水醋酸钠、20%的PEG4000、0.1M硫酸铵)为例:第一步:配好浓度为0.1M,PH4.6的醋酸钠缓冲液;第二步:称好PEG4000和硫酸铵(假如配制体积为50ml)至50ml烧杯中,加入配制好的醋酸钠缓冲液,使其溶解后置50ml容量瓶中定容;第三步:将定容好的溶液用滤膜过滤到50ml的管中,A1条件配制完毕。同样的方法配制其他条件。下面用几种蛋白质的结晶实验来验证该试剂盒的效果。
实施例1:用上述配制的PEG Grid Screen96条件对刀豆球蛋白(ConcanavalinA)进行条件筛选。
第一步:将美国Sigma公司的货号为L7647的刀豆球蛋白,溶于pH为7.0,浓度为0.025mol/L的N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磺酸-Na缓冲液中,配制成浓度为20mg/ml的刀豆球蛋白溶液,用0.22μm的滤膜滤去杂质。
第二步:用上述96条件对刀豆球蛋白结晶条件进行筛选。
第三步:使用坐滴板,每深孔中加入90μl的池液,使用自动移液系统将1μl筛选结晶剂和1μl蛋白质溶液混合为结晶液滴,滴在小坐滴孔中,密封结晶板。
第四步:上述结晶溶液体系在20℃温控箱中放置7天后,利用自动显微拍照系统观察并统计出现刀豆球蛋白晶体的条件数目。
经过统计得到结果如下:刀豆球蛋白结晶的成功率为81.2%,与文献1相比其成功率提高了77.0%,有大幅提高。
实施例2:用上述配制的PEG Grid Screen96条件对溶菌酶(lysozyme)进行条件筛选。
第一步:将经过六次重结晶的日本Seikagaku公司的货号为100940的溶菌酶,溶于pH为7.0,浓度为0.025mol/L的N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磺酸-Na缓冲液中,配制成浓度为40mg/ml的溶菌酶溶液,用0.22μm的滤膜滤去杂质。
第二步:用上述96条件对溶菌酶结晶条件进行筛选。
第三步:使用坐滴板,每深孔中加入90μl的池液,使用自动移液系统将1μl筛选结晶剂和1μl蛋白质溶液混合为结晶液滴,滴在小坐滴孔中,密封结晶板。
第四步:上述结晶溶液体系在20℃温控箱中放置7天后,利用自动显微拍照系统观察并统计出现溶菌酶晶体的条件数目。
经过统计得到结果如下:溶菌酶结晶的成功率为46.9%,与文献1相比其成功率提高了17.7%,有显著提高。
实施例3:用上述配制的PEG Grid Screen96条件对蛋白酶K(proteinase K)进行条件筛选。
第一步:将美国Sigma公司的货号为P6556的蛋白酶K,溶于pH为7.0,浓度为0.025mol/L的N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磺酸-Na缓冲液中,配制成浓度为30mg/ml的蛋白酶K溶液,用0.22μm的滤膜滤去杂质。
第二步:用上述96条件对蛋白酶K结晶条件进行筛选。
第三步:使用坐滴板,每深孔中加入90μl的池液,使用自动移液系统将1μl筛选结晶剂和1μl蛋白质溶液混合为结晶液滴,滴在小坐滴孔中,密封结晶板。
第四步:上述结晶溶液体系在20℃温控箱中放置7天后,利用自动显微拍照系统观察并统计出现蛋白酶K晶体的条件数目。
经过统计得到结果如下:蛋白酶K结晶的成功率为66.7%,与文献1相比其成功率提高了8.4%,有显著提高。
实施例4:用上述配制的PEG Grid Screen96条件对过氧化氢酶(Catalase)进行条件筛选。
第一步:将美国Sigma公司货号为C0615的过氧化氢酶,溶于pH为7.00,浓度为0.025mol/L N-2-羟乙基哌嗪-N’-2-乙磺酸-Na缓冲液中,配制成浓度为20mg/ml的过氧化氢酶溶液,用0.22μm的滤膜滤去杂质。
第二步:用上述96条件对过氧化氢酶结晶条件进行筛选。
第三步:使用坐滴板,每深孔中加入90μl的池液,使用自动移液系统将1μl筛选结晶剂和1μl蛋白质溶液混合为结晶液滴,滴在小坐滴孔中,密封结晶板。
第四步:上述结晶溶液体系在20℃温控箱中放置7天后,利用自动显微拍照系统观察并统计出现过氧化氢酶晶体的条件数目。
经过统计得到结果如下:过氧化氢酶结晶的成功率为30.2%,与文献1相比其成功率提高了14.6%,有显著提高。
除上述的实施例外,本发明方法也用于竹与蛋白、核糖核酸酶A、乳白蛋白、糜蛋白酶以及糜蛋白酶原等结晶条件的筛选,得到的蛋白质结晶筛选成功率也有显著提高。
机译: 用于诊断和筛选肝癌的试剂盒,该试剂盒包含特异于HBX转基因小鼠蛋白质标记的抗体,以及使用该试剂盒诊断和筛选肝癌的方法
机译: 用于寻找蛋白质结晶条件的试剂和用于寻找蛋白质结晶条件的方法
机译: 用于诊断和筛选肝癌的试剂盒,其包含对HBx转基因小鼠衍生的蛋白质标记具有特异性的抗体,以及使用该试剂盒的用于诊断和筛选肝癌的方法