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一种判断可能引起蛋白构象病的蛋白质分子结构转化关键位点的方法

摘要

本发明公开一种判断可能引起蛋白构象病的蛋白质分子结构转化关键位点的方法,包括如下步骤:将已知的有代表性的蛋白质的非冗余数据集作为基础数据;将基础数据中的每个蛋白质分子按照m残基长划分成多肽段,构建多肽段总集合;构建多肽段总集合中每个多肽段的同源多肽段子集合;将待研究蛋白质分子按照m残基长划分成多肽段,并按其起始位置定义为j位多肽段,计算每个多肽段从演化区域跳转到另一区域的跳转概率;滤除进化允许的构象变化;跳转概率最高的多肽段即为可能导致蛋白构象病的关键位点。本发明采用先利用算法排查,再进行实验研究的技术路线,克服了现有蛋白质结构转换研究复杂程度高,人力、财力消耗巨大,耗时长、效率低等问题。

著录项

  • 公开/公告号CN101598723A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2009-12-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国科学院力学研究所;

    申请/专利号CN200810114588.8

  • 发明设计人 刘鑫;赵亚溥;

    申请日2008-06-06

  • 分类号G01N33/48;G06F19/00;

  • 代理机构北京中创阳光知识产权代理有限责任公司;

  • 代理人尹振启

  • 地址 100190 北京市海淀区北四环西路15号

  • 入库时间 2023-12-17 23:10:12

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2013-04-03

    发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):G01N33/48 申请公布日:20091209 申请日:20080606

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2010-02-03

    实质审查的生效

    实质审查的生效

  • 2009-12-09

    公开

    公开

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