确定差异表达基因的混合线性模型两步筛选法

摘要

一种鉴别差异表达基因的方法，其特征在于，该方法通过两个步骤鉴定差异表达基因：先将芯片数据通过噪音过滤消除大的试验系统误差，然后通过单基因模型初步判断符合显著性标准A的差异表达基因；其次，用多基因模型分析这些初定的差异表达基因，选出符合显著性标准B的基因；其中显著性标准A和B之间的关系是A/B≥5，以便控制假阳性。采用Jackknife重复抽样技术估算检验统计量的显著性，在单基因模型中将处理考察因素的方差作为初定差异表达基因的具体指标，在多基因模型中将基因和考察因素的互作效应作为鉴定差异表达基因的具体指标。本发明的方法能够提供可靠的分析结果，大大降低分析结果的假阳性概率，并大幅度提高大规模基因表达数据分析的效率。