一种快速、高通量定位和克隆植物QTL基因的RapMap方法

摘要

本发明公开了一种快速、高通量定位和克隆植物QTL基因的RapMap方法，从核心种质中选取性状差异较小的品系作为梯度亲本，构建尽可能多的F2梯度遗传群体，通过对每个群体分离的两个极端表型DNA池进行芯片检测或二代测序初步定位QTL，根据本发明提出的“共分离标准”在每个梯度群体的单株水平验证QTL，再用QTL杂合家系作为近等基因系进行精细定位来克隆目标基因。梯度遗传群体的概念和“共分离标准”的思想是本发明的核心。本发明应用该RapMap方法成功克隆六个水稻粒长和粒宽基因，表明RapMap是一个集QTL定位、验证及其近等基因系筛选“三位一体”的快速、高通量基因克隆RapMap方法。